Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_PAN3_0004100

Sequence Length

2007 nt

GC Content

0.3622

UUCCAGGAAUGGAUGGAGGUGCUUUAACUGAUACAAGUCUCACAGAUUCCUAUUUUAGCACCAGCUUUAUUGGAGUCAAUGGAUUUGGAAGCCCUGUAGAAACAAAAUAUCCCCUGAUGCAGAGAAUGACUAAUAGUAGCAGCUCCCCAAGCCUUCUAAAUGACAGUGCCAAGCCAUAUUCAGCCCAUGAUCCUCUAACAUCACCUGCUUCAUCCUUGUUUAAUGACUUUGGUGCCCUCAACAUCUCUCAGAGACGAAAGCCAAGGAAGUAUCGCCUGGGGAUGCUGGAGGAGAGGCUAGUUCCGAUGGGAUCAAAGGCACGAAAAGCAAAGAACCCUAUUGGCUGCCUUGCUGACAGGUGUAAAUCAGGAGUACCCAUCAAUAUGGUUUGGUGGAACAGAGUCACAGAAAACAAUUUACAGACACCAAAUCCUACUGCAAGCGAGUUUAUUCCUAAAGGAGGAUCAACCUCCAGGCUGAGUAACGUGUCCCAGUCAAAUAUGUCUGCCUUCUCUCAAGUUUUCUCUCACCCAUCCAUGGGAAGCCCUGCUACUGCUGGAUUAGCGCCAGGUAAGUUGAGUAACUAUUUCCAGUGAGUUCCAGAUACCAUGUCUGUAAGCACCAUUUACUAUUAAUUUAUCAGAACUGAAAUUGUAUACUUGAAUGAUUCACAUUUGAACAUUAAGAGCUUUAUGUUCUAGUUUUUGGUACCAUAGGCCAAAUGUGUAGUUGAGAAUUUUAAAGCAAAAUUUAAAUAUGAAUGAAAUUACAUAUAAGAAUUUUUAUAUAUAAAACUCACAAAAAAAUUUAAAGGGGAAAUGGUUAUUUAGGAAAAAAUCUAUCUUUUUGUAUUUCUCUAUUUUUAAAACUUUGUGCUGUUUCACUCAAACUUACAAAGGCAUCAGAAAGAACGUGAAUAUUUAUGUACAUAUGCCUCAGAGUCCUCCUUUUACAUUAAAUUUCUAAAAAAUAAUUUAAUCAUUCUACAUCUUUAGAUGGUAUUCCCUUUCAGAUAUUUGAUUAUAAAUGCUAUAGUAGUAAUUUUAAAUUGGGUAAAGUAUUAUAAACAGUAGUAGGAAAAAAAUAUACUACAUGAGGGAUCAUUGCAGUAGAGAAAAACACUUUUUAGUUAUCUUCUGCCCAUAAUGUACCCAUAAAGUGUACCCAUAAUGACAGAACAAUUUGGGCAAAUGUGCUUGUACUCCAGGAGUCCUGAAGGCAUAGUUCAAUGUGACCCUUUGAGAAAUCUAUGAUUCUUUGCAGUCUUCAUUUUUAUCUUAAGAAUUCAUGCAGAUUUUGCAUCUGCUACUCCAUAAUGUUUAUUUUAGUAUAAAAAUAUUUAAAUUUUUAAAAUUAACAUCACUUAUCCCCACUGCUGUAUACCUUGAUUUGGAAAGUAAGGUGGUAUGCACAAUCACAUUGAAUUCAUAGUAAGUGCUGAGCAGAUUGGUAUCUUAUGUUUGUCGAAUGUUUGAGUUGCACACACAAAUUAGGCUUCUAGAACCUAUACAGGAAAAUCAUCACUUGGUCUUGGACAUUAAAAAAAAAAACAGAAAUAAAAUGAAAUAUAUACACACACUAAAACAAAGCCAAAGGAUAUAUCUAGAUCAGCCAGGAACUGGUACUGUCUCCAGGGCUUAAUCUAAUUAGUAAGUAAAUCGUUGAUUUAAAUACUCAUAUAUCUAAUUCAAGGACCUCUUUGGGAAGAAAAAUGGGAGAAGAUAAAGAUAACACAGUGGCGCAGAGCAUCUGUUUUAGCAUUAAAGUAUCAGAGUACUCAGAGCUUAAUAACCUUGUGUUGCUAAGGAUUUUGUCAGCGCCUCAUUUCCCCACCAUUCUUUCUCUUACUACCUGUCUCCCUUCCAACUCCCCUCCCACCACUUGUUCCCUUACCUUUUCUUCUACUUUGGUUUUUUUCCAGGUUCAGUUAAAUUUGUAAGCAUUUUCCUUUCUUCCCUAGAGAGCAGUGUCAGAAUUGAAUAUCUCUGGUAGCCUUAAAGUUUUAUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-440.63 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -483.61

Frequency: 0.0000

Diversity: 483.82

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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