Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PAN3_0006600
Sequence Length
1672 nt
GC Content
0.4288
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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-423.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -457.75
Frequency: 0.0000
Diversity: 439.37
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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