Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PAN3_0009400
Sequence Length
432 nt
GC Content
0.5208
CCAAGGAAGUAUCGCCUGGGGAUGCUGGAGGAGAGGCUAGUUCCGAUGGGAUCAAAGGCACGAAAAGCAAAGAACCCUAUUGGCUGCCUUGCUGACAGGUGUAAAUCAGGAGUACCCAUCAAUAUGGUUUGGUGGAACAGAGUCACAGAAAACAAUUUACAGACAGGGUCUCACUCUGUUGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGUGCAGUCUUGGCUCACUGCAACCUCUGCCUCCCAGGCUCAAGCGAUGCUCCCUCUUCAGCCUCCCAAGUAGCUGGGACCACAGACACCAAAUCCUACUGCAAGCGAGUUUAUUCCUAAAGGAGGAUCAACCUCCAGGCUGAGUAACGUGUCCCAGUCAAAUAUGUCUGCCUUCUCUCAAGUUUUCUCUCACCCAUCCAUGGGAAGCCCUGCUACUGCUGGAUUAGCGCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-132.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -141.00
Frequency: 0.0000
Diversity: 68.90
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..(((........))).((((.((((((((((..(((.(..((((((((.((....((((....(((((.(...((....))...).))))).....)))).......))...)))))).....(((((((.(.((((((((...(((...................))).)))))))).))))))))((((.((((.((((((((........))))).))).))))))))..))..).)))....))))...)))))).)))).((((((.(((....((((((.........((((...(((.(((.((((.....(((((.....))))).....))))))).)))..))))......)))))).((((((........................))))))))).)))))))((((.......))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(..(((........))),((((.((((((((,(((((.((..((((((((.{{....((.......))...}}.,))})))))))))))|{{,....|||,,...,,.((((((.(((((((......))))))){(((((((...{{{............{,,...,))).))))))))((..{(,((((((.((((.((((((((........))))),,)).)))))))),}),))...)),.))))))})))))))).)))).((((((.(((....((((((.........((((...(((.({({((((.....(((((.....))))).,...))))))).)))..))))......))))))..,.......,,..........{({,....})))..,))).)))))))((((.......))))
Back