Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PAN3_0010500
Sequence Length
357 nt
GC Content
0.4678
CCAAGGAAGUAUCGCCUGGGGAUGCUGGAGGAGAGGCUAGUUCCGAUGGGAUCAAAGGCACGAAAAGCAAAGAACCCUAUUGGCUGCCUUGCUGACAGGUGUAAAUCAGGAGUACCCAUCAAUAUGGUUUGGUGGAACAGAGUCACAGAAAACAAUUUACAGACACCAAAUCCUACUGCAAGCGAGUUUAUUCCUAAAGGAGGAUCAACCUCCAGGCUGAGUAACGUGUCCCAGUCAAAUAUGUCUGCCUUCUCUCAAGUUUUCUCUCACCCAUCCAUGGGAAGCCCUGCUACUGCUGGAUUAGCGCCAGAGAGCAGUGUCAGAAUUGAAUAUCUCUGGUAGCCUUAAAGUUUUAUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-91.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -97.07
Frequency: 0.0001
Diversity: 68.65
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((........))).))((((((.((((.(((((.((..((((((((.......((.......)).......)))))))))))))))((((((((..(((...((((.((..(((((((......)))))))....(((....(((((((......((((((.........((((...(((.(((.((((.....(((((.....))))).....))))))).)))..))))......))))))...........)))))))))).((((....))))..)))))).)))..)))..)))))((((((((.((((......))))....))))))))..))))..)))...)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.(((........))).))(((((({,,((.(((((.((..((((((((.{{....((.......))...}}.,))})))))))))))),||,,|||.,{{{..,((({.((..(((((((......)))))))....(((....(((((((......((((((.........((((...(((.({({((((.....(((((.....))))).,...))))))).)))..))))......))))))...........)))))))))).((({....))))..||}}}),))),,))),.})}}}((((((((.,,{{.,,,..,,)),...)))))))).,)}}}..,}}..,)))
Back