Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PAN3_0015200
Sequence Length
1502 nt
GC Content
0.4274
GGAACAAGCUACCCUCUGAGUCAGCACUGGACUUGAAGAUAAAUCCUACAAUUCAUGAAACUGACUGAUUCGACUAAAGGAUGGAUAGUUUGGGCAGCGUUGGACAGCUCUAUGAGGGGAAUGUCGUUGUCUGCUGGGUCUUCCCCUCUUCAUUCCCCCAAGAUUACUCCACAUACUUCUCCUGCUCCCAGAAGAAGAAGUCACACUCCAAAUCCAGCAAGUUACAUGGUGCCUUCUAGUGCCUCUACAUCUGUUAAUAAUCCUGUUUCUCAGACUCCGUCUUCUGGUCAGGUGAUCCAAAAGGAAACUGUUGGUGGGACGACUUACUUCUAUACAGACACAACUCCAGCACCUUUGACUGGAAUGGUGUUUCCAAACUAUCAUAUUUAUCCUCCAACUGCACCUCACGUUGCUUAUAUGCAACCGAAAGCAAACGCACCUUCCUUCUUCAUGGCUGAUGAACUCCGACAGGAGCUGAUCAACAGACAUUUAAUAACAAUGGCUCAAAUUGAUCAAGCAGAUAUGCCAGCAGUUCCUACAGAGGUUGACAGCUACCAUAGCCUAUUCCCUCUAGAACCACUGCCACCUCCCAACCGGAUACAGAAAUCAAGUAAUUUUGGAUAUAUUACAUCUUGCUACAAAGCUGUAAACAGCAAAGAUGAUCUGCCAUAUUGCCUUCGGAGGAUACAUGGUUUUCGUCUUGUUAACACAAAGUGCAUGGUGUUGGUCGACAUGUGGAAGAAAAUUCAACACUCAAAUAUCGUAACUUUGCGUGAAGUAUUUACCACUAAAGCAUUUGCUGAGCCCUCUCUUGUGUUUGCAUAUGAUUUCCAUGCUGGAGGAGAAACUAUGAUGAGCAGACACUUUAAUGACCCUAAUGCUGAUGCCUACUUCACCAAGAGAAAGUGGGGUCAGCACGAGGGACCAUUGCCCAGGCAGCAUGCUGGAUUAUUGCCAGAAUCUCUUAUUUGGGCAUAUAUUGUCCAACUAAGUUCUGCAUUGCGUACCAUUCAUACAGCAGGUUUGGCAUGUCGAGUUAUGGAUCCAACAAAGAUUCUGAUAACUGGCAAAACAAGGUUGCGAGUAAAUUGUGUUGGAGUUUUUGAUGUUUUAACAUUUGAUAACAGUCAAAAUAAUAAUCCAUUGGCAUUAAUGGCCCAGUACCAGCAAGCAGAUCUGAUAUCAUUAGGAAAAGUUGUGUUGGCUUUGGCUUGCAACUCUUUGGCAGGAAUUCAGCGAGAGAAUUUACAGAAAGCCAUGGAACUGGUGACAAUCAACUAUUCCUCUGACCUGAAGAAUCUGAUUUUGUAUUUGUUGACUGACCAAAACAGGAUGCGAAGUGUAAAUGACAUCAUGCCCAUGAUUGGUGCUCGAUUUUAUACUCAAUUGGAUGCUGCUCAAAUGAGAAAUGAUGUCAUAGAGGAAGACCUUGCAAAGGAGGUUCAAAAUGGAAGACUGUUUAGGCUCCUAGCAAAAUUGGGAACAAUCAAUGAGAGGCCGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-403.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -432.89
Frequency: 0.0000
Diversity: 421.49
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..........))((((((((((((.((((.(((.((.......)).)))))))))...))))))...........((((((((((((((((..(((........)))....((((((((.(.(.(........).).))))))))).....((((((((.(....(((.......((.((((...((((((((.(.(((((((..........((((.((.....(((((......))))).....)).))))........)))......)))).).)))))))).)))).)).......)))...).)))).))))................((((((...(((((((....)).)))))...)))))))))))))))).....))))))......((..((((.(((((......))))).....((....))..(((((((.((((((((((((.(.((((....)))).).)))....................(((((...(((((((.(((....)))..(((((......(((((......((((...))))......)))))......)))))....(((.....))).........((((....))))........(((((.(((.((...((((....)))).(((((((...(((((.(..(((....)))..).)))))..)))))))...........))))).))))))))))))...((((.(((...((((............((((....))))))))...))).))))...(((....))))))))(((((..((((((((.(((.((((((........))))).....).))).))))))))........((((..(((((((.((((((((.......).))))))))))))))..))))....((((....))))...((((((((.((((((((....((((.(((((((.....))))))).)))).(((((.(((((((((((...(((.((((.((((...((((.(((((((((((.......)))))..))))))))))...)))).))))..)))....))).(((.(((.((((((((......((((((....)))))).............)))))))).))))))))))..))))))))).(((((...)))))....((((((...(((....))).)))))).)))))))).)))))))))))))...........)))))))))..((((....))))...((((.((......)).))))...((((((((((((((..........)))).))))))))))....(((((((((((((((....))).))...........((((.((((.......)))).))))..)))))))))).)))))))...((((..(((((.((..((((((....)))))))).))))).)))).((((....))))...))))..))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,.........}}({(((((((({{,,,((.(((.((.......)).)))}))}.}...}))})),},,,......{((((((((((((((({.(((....,,..}}|,,..((((((((,{,{.,......,.|||.,})))))))..,..((((((((.{....(((.......((.((((...((((((((.{.((((.............((({.{{.....(((((......)))))......,,))},........||}....,,)))).,.)))))))).)))).)).......)))...}.)))).)))).|,.......,.....{(((((...(((((((....)).)))))...)))))))))))))))).....)})))|,,....((..(((,.(((((......))))).....((....))..(((((((,(((((((({{{{,|.((((....)))).|{|||{,.,{.{{{{.......,}}|,||,...|||}}}}.(((....|}},.(((((......(((((......((((...))))......)))))......)))))....,,{,....}||,,{,,,.,,{,,{,,.,,}}||.....,,,(({((({{{,,...|,|}},...})),||||||{...||||{.|..{{{,,,,|||,.,,|||||,,||}}}}|||,.,,,|,,.|{||,{{({{{{{{|||,..,(({({{{{,,.((({{(((.......{{{{{{{{|||.||{,,...,}},}}}}...,{{...,||||||||.,{,,..((((((((.(((.((((((......,.)))),....,).))).))))))))..,{(((.((((..(((((((.((((((((.......),})))))))))))))..))))..)))||,{{,,}|,....|||||,,,..((((((({...((((.(((((((.....))))))).))))}|||||,,((((((,......|||.||||}||||}},((((.(((((((((((.......)))))..))))))))))...))))}))))}},,.....)))}|||},||}||{((({,,,,,,,|{{({{....)))))}.......,|||||{||,,,,,}))})}}))))},})|||||||,(((({,,.||}}},...{||{|||},||{.,,.)))}))}},|{|||,||,|.,,,}),)),))))}.......},})))))))},..((((....,,},,}}}|||}||}},...}},)},,.,,((((((((((((((,.........})))}}}))))))))....(((((((((((((((....))).)).,,,,,.....{{{|,||||...,..,})}}.))))..)))))))))).)))))))...((((..(((((.({..((((((....))))))}).))))).)))).{(((,...,,,),,,))))..)),)))
Back