Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PAN3_0021300
Sequence Length
1499 nt
GC Content
0.4149
CAGUUCCUACAGAGGUUGACAGCUACCAUAGCCUAUUCCCUCUAGAACCACUGCCACCUCCCAACCGGAUACAGAAAUCAAGUAAUUUUGGAUAUAUUACAUCUUGCUACAAAGCUGUAAACAGCAAAGAUGAUCUGCCAUAUUGCCUUCGGAGGAUACAUGGUUUUCGUCUUGUUAACACAAAGUGCAUGGUGUUGGUCGACAUGUGGAAGAAAAUUCAACACUCAAAUAUCGUAACUUUGCGUGAAGUAUUUACCACUAAAGCAUUUGCUGAGCCCUCUCUUGUGUUUGCAUAUGAUUUCCAUGCUGGAGGAGAAACUAUGAUGAGCAGACACUUUAAUGACCCUAAUGCUGAUGCCUACUUCACCAAGAGAAAGUGGGGUCAGCACGAGGGACCAUUGCCCAGGCAGCAUGCUGGAUUAUUGCCAGAAUCUCUUAUUUGGGCAUAUAUUGUCCAACUAAGUUCUGCAUUGCGUACCAUUCAUACAGCAGGUUUGGCAUGUCGAGUUAUGGAUCCAACAAAGAUUCUGAUAACUGGCAAAACAAGGUUGCGAGUAAAUUGUGUUGGAGUUUUUGAUGUUUUAACAUUUGAUAACAGUCAAAAUAAUAAUCCAUUGGCAUUAAUGGCCCAGUACCAGCAAGCAGAUCUGAUAUCAUUAGGAAAAGUUGUGUUGGCUUUGGCUUGCAACUCUUUGGCAGGAAUUCAGCGAGAGAAUUUACAGAAAGCCAUGGAACUGGUGACAAUCAACUAUUCCUCUGACCUGAAGAAUCUGAUUUUGUAUUUGUUGACUGACCAAAACAGGAUGCGAAGUGUAAAUGACAUCAUGCCCAUGAUUGGUGCUCGAUUUUAUACUCAAUUGGAUGCUGCUCAAAUGAGAAAUGAUGUCAUAGAGGAAGACCUUGCAAAGGAGGUUCAAAAUGGAAGACUGUUUAGGCUCCUAGCAAAAUUGGGAACAAUCAAUGAGAGGCCGGAGUUUCAGAAGGAUCCCACUUGGUCAGAGACUGGAGACCGUUAUCUGUUGAAACUCUUUAGGGAUCAUCUUUUUCAUCAGGUGACAGAAGCAGGUGCUCCCUGGAUUGACCUCAGUCAUAUAAUUUCUUGUCUUAACAAGCUAGAUGCUGGUGUGCCAGAAAAAAUAAGCCUGAUUUCCAGAGAUGAGAAGAGUGUACUUGUGGUGACCUACAGUGACUUAAAGCGCUGCUUUGAAAAUACUUUUCAAGAACUGAUUGCAGCUGCAAAUGGUCAGUUGUAGUAUUUGCUAAAAAAGCACGCAGGACAUGGCUAAAGACCUUAACCAAUAGCAAAUUGCACUACAGCUGAACUUUUCAUCAUCUCAUUCACAUUUGGGAAACGAACAGGAGAUGAGCAAAGCUGCUUGCACUUCAGUCAGGUACACUGUUACUUGAAAGGAAGAAUGUUUCACUUACCCAAGAGCUAUGGCUGCCAUUGGAGGCUGUUAUCUGUGAAGAAUUUAUUUUAGAUUUAGGAGCACCAUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-416.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -446.36
Frequency: 0.0000
Diversity: 278.65
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((.((.((((.(((((((.((((((((......((((.......(((...((........))...)))...((((((((((((((.((((((((((((.(((.....((((....)))).(((((((...(((((.(..(((....)))..).)))))..)))))))(((((.(((((((..((((((..((((((........(((((.((((((((.......(((((((((((.(((..........))).........(((((((((.......((((((((.(((.((((((........))))).....).))).))))))))..(((((.((((..(((((((.((((((((.......).))))))))))))))..))))..))))).((((........)))).....(((.((((...((((.(((((((.....))))))).))))))))))).((((((.......))).))))))))))))((((.(((((((((((.......)))))..))))))))))...))))))))))).......)))))))).)))))((.(((((((((...((((((.(((...........((((((....)))))).(((((.(((((((((...((((((...))))))....))).))))))...((((((.....(((((.((.........)).))))).........)))))).((((.((((........))))))))(((((((...........((((((((((((((..........)))).))))))))))....(((((((((((((((....))).))...........((((.((((.......)))).))))..))))))))))..(((....)))(((..(((((.((..((((((....)))))))).))))).)))....(((((.(..((..(((((........)))))))..).)))))...))))))).))))).))).)))))))))))))))))((((((((.(((((.((((.((....))..)))).))))).)))))))))))))).)).))))...)))..)))).))))).))).))))).))))))))))))........((((((((....((((((((((((((....((((((((..(((((((((((....(((((((((((((((...))))))))........))))).))....))))).))))))....((((.....))))...........((((..(........)..))))......))))))))....))))))).))))))).......((((.....))))..((((.((((((....))))))..)))))))))))).....)))))))))(((((((....)))).))).....))))....)))))....))).))))))))))).))..(((((((...)))))))))))))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((({((.(((,{(((((((.((((((((......((((.,.....{{{....,{{(,,...}},..,,|,,{(((,((,{((((((.((((((((((((.(((.....((((....)))).{((((((...(((((.{..(((....)))..}.)))))..))))))|(((((.((((,{{,,((({{{..{{{|{,},,}}...{((({.((((((((.......(((((((((((.(((,,....,}},,,,.........(((((((((.......((((((((.(((.((((((......,.)))),....,).))).))))))))..{((((.((((..(((((((.((((((((.......),})))))))))))))..))))..))))}.((((,{,...,})))).....(({{((((...((((.(((((((.....))))))).))))))))))).((((({.......))).))))))))))))((((.(((((((((((.......)))))..))))))))))...))))))))))).......)))))))).)))))({.(((((((((...((((((.(((...........((((((....)))))).(((((.(((((((((,,,((((((...}||}}}....))}.)))))),,.{(((({,,,,.(((((.((.,,....}.)).))))).,,....,.,))))).||{{.((((......,.})))}}}|(((((((.,,.,...,..((((((((((((((..........))))}})))))))))....(((((((((((((((....))).)).,,,,,.....{{{|.||||...,..,})}}.))))..)))))))))).,{((....))}{((..(((((.({..((((((....))))))}).))))).))}....(((((.{..((..(((((........)))))}}..).))))).},)))))))}))))).))).)))))))))))))))}){(((((((.(((((.((((.({....)}..)))).))))).)))))))}|||||,.,,}))),...,,,..}))).))))),))).))))).)))))))))))),.......||{|||||}}..((((((((((((((.,{.((((((((..((((({(((((....(((((((((((((({...})))))))........))))).))....))))).}))))).,,,((((,....}}},..,,,,...,{({{{..,.......,)..)))),,,}.,)))))))).}}.))))))).)))))))...,....||}}}}........{(((.{(((((....))))),..}))).,||||||,....,,))))))),{((({|....}))).})}...,.))))..,.)))))....))).))))))))))).))..{((((({...)))))))))))))..,....,
Back