Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PAN3_0022500
Sequence Length
476 nt
GC Content
0.4097
GUUUUCGUCUUGUUAACACAAAGUGCAUGGUGUUGGUCGACAUGUGGAAGAAAAUUCAACACUCAAAUAUCGUAACUUUGCGUGAAGUAUUUACCACUAAAGCAUUUGCUGAGCCCUCUCUUGUGUUUGCAUAUGAUUUCCAUGCUGGAGGAGAAACUAUGAUGAGCAGACACUUUAAUGACCCUAAUGCUGAUGCCUACUUCACCAAGAGAAAGUGGGGUCAGCACGAGGGACCAUUGCCCAGGCAGCAUGCUGGAUUAUUGCCAGAAUCUCUUAUUUGGGCAUAUAUUGUCCAACUAAGUUCUGCAUUGCGUACCAUUCAUACAGCAGGUUUGGCAUGUCGAGUUAUGGAUCCAACAAAGAUUCUGAUAACUGGCAAAACAAGGUUGCGAGUAAAUUGUGUUGGAGUUUUUGAUGUUUUAACAUUUGAUAACAGUCAAAAUAAUAAUCCAUUGGCAUUAAUGGCCCAGUACCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-127.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -138.24
Frequency: 0.0000
Diversity: 86.66
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((....((((....)))))).)).(((((((((.....((((.(((((...((((((((.......(((((((((((.(((..........))).........(((((((((.......((((((((.(((.((((((........))))).....).))).))))))))..(((((.((((..(((((((.((((((((.......).))))))))))))))..))))..))))).((((........)))).....(((.((((...((((.(((((((.....))))))).))))))))))).((((((.......))).))))))))))))((((.(((((((((((.......)))))..))))))))))...))))))))))).......)))))))).))))).)))).......((((((....))))))........((((((....)))))).))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((...,,..{{{,....}}}},}.)}.((((((((({{{..{{{(,({,((({.((((((((.......(((((((((((.(((,,....,}},,,,.........(((((((((.......((((((((.(((.((((((......,.)))),....,).))).))))))))..{((((.((((..(((((((.((((((((.......),})))))))))))))..))))..))))}.((((,{,...,})))).....(({{((((...((((.(((((((.....))))))).))))))))))).((((({.......))).))))))))))))((((.(((((((((((.......)))))..))))))))))...))))))))))).......)))))))).))))},{(({....}}}|{((((....))))),.......,|||||,,},,,,,))),))))))))).
Back