Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_PAN3_0022800

Sequence Length

1337 nt

GC Content

0.4129

GUUUUCGUCUUGUUAACACAAAGUGCAUGGUGUUGGUCGACAUGUGGAAGAAAAUUCAACACUCAAAUAUCGUAACUUUGCGUGAAGUAUUUACCACUAAAGCAUUUGCUGAGCCCUCUCUUGUGUUUGCAUAUGAUUUCCAUGCUGGAGGAGAAACUAUGAUGAGCAGACACUUUAAUGACCCUAAUGCUGAUGCCUACUUCACCAAGAGAAAGUGGGGUCAGCACGAGGGACCAUUGCCCAGGCAGCAUGCUGGAUUAUUGCCAGAAUCUCUUAUUUGGGCAUAUAUUGUCCAACUAAGUUCUGCAUUGCGUACCAUUCAUACAGCAGGUUUGGCAUGUCGAGUUAUGGAUCCAACAAAGAUUCUGAUAACUGGCAAAACAAGGUUGCGAGUAAAUUGUGUUGGAGUUUUUGAUGUUUUAACAUUUGAUAACAGUCAAAAUAAUAAUCCAUUGGCAUUAAUGGCCCAGUACCAGCAAGCAGAUCUGAUAUCAUUAGGAAAAGUUGUGUUGGCUUUGGCUUGCAACUCUUUGGCAGGAAUUCAGCGAGAGAAUUUACAGAAAGCCAUGGAACUGGUGACAAUCAACUAUUCCUCUGACCUGAAGAAUCUGAUUUUGUAUUUGUUGACUGACCAAAACAGGAUGCGAAGUGUAAAUGACAUCAUGCCCAUGAUUGGUGCUCGAUUUUAUACUCAAUUGGAUGCUGCUCAAAUGAGAAAUGAUGUCAUAGAGGAAGACCUUGCAAAGGAGGUUCAAAAUGGAAGACUGUUUAGGCUCCUAGCAAAAUUGGGAACAAUCAAUGAGAGGCCGGAGUUUCAGAAGGAUCCCACUUGGUCAGAGACUGGAGACCGUUAUCUGUUGAAACUCUUUAGGGAUCAUCUUUUUCAUCAGGUGACAGAAGCAGGUGCUCCCUGGAUUGACCUCAGUCAUAUAAUUUCUUGUCUUAACAAGCUAGAUGCUGGUGUGCCAGAAAAAAUAAGCCUGAUUUCCAGAGAUGAGAAGAGUGUACUUGUGGUGACCUACAGUGACUUAAAGCGCUGCUUUGAAAAUACUUUUCAAGAACUGAUUGCAGCUGCAAAUGGUCAGUUGUAGUAUUUGCUAAAAAAGCACGCAGGACAUGGCUAAAGACCUUAACCAAUAGCAAAUUGCACUACAGCUGAACUUUUCAUCAUCUCAUUCACAUUUGGGAAACGAACAGGAGAUGAGCAAAGCUGCUUGCACUUCAGUCAGGUACACUGUUACUUGAAAGGAAGAAUGUUUCACUUACCCAAGAGCUAUGGCUGCCAUUGGAGGCUGUUAUCUGUGAAGAAUUUAUUUUAGAUUUAGGAGCACCAUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-372.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -398.70

Frequency: 0.0000

Diversity: 366.34

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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