Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PAN3_0024200
Sequence Length
740 nt
GC Content
0.3527
UUCUCCUUCCCAUGCCAGCUUCCCUCCUGCCAUUCUGGGCUCCUGACUCUAUCACCAGUGAAGUUUUAAAAGUUUUCUGGGAUGAAUCUUUGAAUCUUUUCUAAUAGAUUCAAAGUAGUUUGUCUACCUAAUCAGUCUGUCUCCUUAUCUCAUGUUCAGUGUCAGAUUCACAAAUGCUAGUUUUGGAUAAAUUUUUUAGUAUGAACUUUUAAAUGUUAUUUUAGUAAUGGAGUUUAACGUCUUUUUACUCAUUAUUUGGGUAGGCUGUUGUUAAGUAUAACCAUAUAAUGCUAGAAUUUCACUAAUGAUUGCCUUAAAGUUACAAAUAUUCCAACAAACCAGUGGUUCUCAAUCCUGGCUGCAUAUUACCAUCAUUUGUGGAAGCUUAGAAAAAUACCAAUACCUAGAUUUUUAUCCCAGACUAAUUAUACCAAAAUUGGGACGAGGGGAUGGCUACUGCUGAUUUUGGUUUUGUUUUUAAGCUUCUCAAGUGAUGGUAAUAUACAGCUAUGCUUGAAAAUUCCUUAUAAUAAACGAAUGUUCAGUAAAUGAACGUGUGUCUAAUAAUUUAGAUGAGUUCUCAGAUUUUAAAGAUCUGCAAAUGUCUGUUGUAGAAAUUGCUUCAGGUGGUUUCAUGUUAACUCUGAAGUACUCCAUUCUUGAAGGCAUGUGGUUGUUAAUAGCUUCCUACCAAUCAGGGCCACUUGGGAUGACCAUACUGUUUCCUGGAGUUAUAAUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-182.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -199.82
Frequency: 0.0000
Diversity: 155.34
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((.....(((.(((........))).)))....(((.(((((((((((.((.(((((...(((((((((((....((((((((((((((((((........))))))))))..))))))))........((((((.(..((...(....)...)).).)))))).....(((((((...............))))))))))))))))))..)))))...)).))))))).........................((((((..(((((((...((((((((...(((((.....((((..(((((.(((.(((.(((((((............((((...)))).((((.(.((((((.((((((((((((((((.(((((((((((((...(((((....(((....(((((((...((((((.......))))))......)))))))......)))...)))))....))))))))))))))))))))))))))))).)))))).).))))........(((((((.((..(((((((.....)))))))..((((((....))))))..(((..(((((((...)))))))..))))).)))))))(((((((((...))))))))).)).))))).))).))).).))))..))))))))))))))))))))))))..))))))...)))))))....((((.(((......))))))))))).........
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.,{{{.{(((({(.(((........))).}},...,(((.(((((.,,{(({.((((.(((.((....}).))).))))|||||,.((((((((((........)))))))))).,{||||||||.......((((((.(..,,.,.{....}...,).).)))))}.....{{{{{{|...}}}},}}}},..,}}}}}},|||,...,,,.}}},,,..{(((({||{({..,,.....,,..)))}}}}}},..((((((..(((((((...(((((((((...{{{{.....{(({..{{{{|.{((,((,.(({{,,.......,{,,,.,{{,.,.}|||.((((.(.((((((.((((((((((((((((.(((((((((((((...(((((....{((....{((((((...((((((.......))))))......))))))}.....,}}}...)))))..,.))))))))))))))))))))))))))))).)))))).).))))..,,,..,,,,,,,,.{,,.(((((((.....))))))).,((((((....)))))),.{{{..(((((({...}))))))..},},},}))))}}||,,,(((({{{|||||||....,..))))})))})))...,}}},,)}))))))))))))))))))))))..))))))..))))))))...,)))).},....}{{{{{....,,,,....}}}})
Back