Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PAN3_0024800
Sequence Length
250 nt
GC Content
0.3720
CUGCCCAUUCUGAUCUUUCUGUGUAGCCCUGGAUGAUCCAGUUUCUUUUUGGACCAGCCCUGGGGUAUGAAUUGGGGGAUGGAGGGUGGGAUUGCCCACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNUUACUUGAAAGGAAGAAUGUUUCACUUACCCAAGAGCUAUGGCUGCCAUUGGAGGCUGUUAUCUGUGAAGAAUUUAUUUUAGAUUUAGGAGCACCAUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-51.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -54.99
Frequency: 0.0029
Diversity: 40.61
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((..((((.(((((((..((((.(((.((.((.(((((.......))))).))..)).))).))))....)))))))))))((((((....)))))).....................................................((((.(((((((....)))).)))...))))......))).)(...(((..(((.(((..(.((((........)))).)..))).))).)))...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.(((,,((((.{((((((..{(((.(((.((.((.(((((.......))))).)).,)}.))).)))}.,..)))))))))},((((((....)))))).....................................................((((.(((((({....}))).)))...))))......))).)(...(((..(((.(((,,(.{(((,......})))),)..))).))).)))...)
Back