Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PCBP2_0006400
Sequence Length
380 nt
GC Content
0.4868
GCCUAUACCAUUCAAGGACAGUAUGCCAUUCCACAGCCAGAUUUGACCAAGCUGCACCAGUUGGCAAUGCAACAGUCUCAUUUUCCCAUGACGCAUGGCAACACCGGAUUCAGUGGCAUUGAAUCCAGCUCUCCAGAGGUGAAAGGCUAUUGGGCAGGUUUGGAUGCAUCUGCUCAGACUACUUCUCAUGAACUCACCAUUCCAAACGAUUUGAUUGGCUGCAUAAUCGGGCGUCAAGGCGCCAAAAUCAAUGAGAUCCGUCAGAUGUCUGGGGCGCAGAUCAAAAUUGCGAACCCAGUGGAAGGAUCUACUGAUAGGCAGGUUACCAUCACUGGAUCUGCUGCCAGCAUUAGCCUGGCUCAAUAUCUAAUCAAUGUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-106.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -112.88
Frequency: 0.0000
Diversity: 70.64
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.....((......)).(((((.(((.((((((..(((((((((.(((((((.((((((((((((((((.(((((((.......(((((...))))).......)))))..)).))))))...)))))).......))))...))))..))).)))))))))..(((((((..(.((.....((((((((...............(((((((........)).)))))(((((....)))))....)).)))))))).).))))))).((((.(((((.......)))))..)))))))))))).).)))))...(((((....(((....))).....))))).......))(((((................)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((..,..((......)).(((((.,((.((((((..(((((((((.(((((((.(((({(((((((((((.,{,((({.......{{{{|..,))))).}}....|||||,,||.}})))),,,))})}}.......))))...))))..))).)))))))))..(((((((..,.((,....((((((({.....,,,.,.....,,,|||||.||,...,..}}}}}(((((....)))))....}),})))))}}.),))))))).((((.(((({.......}))))..)))))))))))).,.)))))...(((((....(((....))).,...))))).......))(((((................)))))
Back