Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PDS5B_0000900
Sequence Length
378 nt
GC Content
0.4259
GUUUGUUACAUAUGUAUACAUAUACCAUGUUGGUGUGCUGCACCUGUUAACUCGUCAUUUACAUUAGGUAUAUCUCCUAAUGCUAUCCCUCUCCCCUCCCUUCCCCUCACCCCACUACAGGCCCUGGUGUAUGAUGUUCCCCACCCUGUGUCCAAGUGUUCUCAUUGUUCAAUUCCCACCUAUGAGUGAGAACAUGUGGUGUUUGGUUUUCUGGCCUUGCAAUAGUUUGCUCAGAAUGAUGGUUUCCAGCUUCAUCCAUGUCCCUACAAAGGACAUGAACUCAUCCUUUUUUAUAGCUACAUAGUAUUCCAUGGUGUAUAUGUGCCACAUUUUCUUAAUCCAGUCUAUCUUUGAUGGACAUUUGGGUUGGUUCUAAGU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-91.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -95.88
Frequency: 0.0008
Diversity: 47.27
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((...........(((((.((((((((((.((.((((..((..(((..(((.((((((((.(((((((.......))))))).................................((((((...(((.(.........).))).)))))).(((.(((((((((((..................))))))))))).))).....((((....))))..((((....))))...)))))))))))..))).......(((((((.......)))))))..................))..)))).))...)))))))))).))))).))((((..(((((((((((((((...)))))))...))))))))....))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((..{.,{{{{,.{{,,,.{(((((((((.((.((((..((..(((..(((.((((((((.(((((((.......)))))))..........................,,.,,{{((((((...(((.(.........},))).)))))).{{{.(((((((((((..................))))))))))),))).,...||{{....})}}..((((....))))...)))))))))))..))).......(((((((.......)))))))..................))..)))).))...))))))))))}))))}.))((((..(((((((((((((((...)))))))...))))))))....))))
Back