Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PDS5B_0003600
Sequence Length
331 nt
GC Content
0.3837
GGGUAGAAAUAUUUCUGUCAUGGCUCAUUCAAAGACUAGGACCAAUGAUGGAAAAAUUACAUAUCCGCCUGGGGUCAAGGAAAUAUCAGAUAAAAUAUCUAAAGAGGAGAUGGUGAGACGAUUAAAGAUGGUUGUGAAAACUUUUAUGGAUAUGGACCAGGACUCUGAAGAAGAAAAGGAGCUUUAUUUAAACCUAGCUUUACAUCUUGCUUCAGAUUUUUUUCUCAAGCAUCCUGAUAAAGAUGUUCGCUUACUGGUAGCCUGCUGCCUUGCUGAUAUUUUCAGGAUUUAUGCUCCUGAAGCUCCUUACACAUCCCCUGAUAAACUAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-73.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -81.83
Frequency: 0.0000
Diversity: 83.63
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((....(((.((((((((((((.((.............)))).)))))))))).)))..(((((.((..(((((..(((...((((((.((((((((((.....((.((((.(((((..........(((((.......(......)......)))))....(((((((((((...((((((............))))))...)))).)))))))......)))))..)))))).....)))))))...))))))))).)))...))))))).)))))((((((((.......))))))))............)))((..........))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((..,.{((.((((((((((((,({..,,...,,...}),)),,))))))))).))}..,{(((,{{..{({{{.,(((...((((((.{{,{((((((.....((.({{(.((((({{{,,,....|{||||,.....,..,..{|{.....,,))},{{.(((((((((((...((((((............))))))...)))).))))))).},},.))))),.)))))).....)))))))...}}}))||||,}}}.}})))}.)).)))))|(((((((.......))))))),.,,,,,......)))((..........))
Back