Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PDS5B_0006900
Sequence Length
891 nt
GC Content
0.3692
GAUAUAUUUAUGUUUAUAACAAGACAGUUGAAGGGGCUAGAGGAUACAAAGAGCCCACAAUUCAAUAGGUAUUUUUAUUUACUUGAGAACAUUGCUUGGGUCAAGUCAUAUAACAUAUGCUUUGAGUUAGAAGAUAGCAAUGAAAUUUUCACCCAGCUAUACAGAACCUUAUUUUCAGUUAUAAACAAUGGCCACAAUCAGAAAGUCCAUAUGCACAUGGUAGACCUUAUGAGCUCUAUUAUUUGUGAAGGUGAUACAGUGUCUCAGGAGCUUUUGGAUACGGUUUUAGUAAAUCUGGUACCUGCUCAUAAGAAUUUAAACAAGCAAGCAUAUGAUUUGGCAAAGGCUUUACUGAAGAGGACAGCUCAAGCUAUUGAGCCAUAUAUUACCAAUUUUUUUAAUCAGGUUCUGAUGCUUGGGAAAACAUCUAUCAGCGAUUUGUCAGAGCAUGUCUUUGACUUAAUUUUGGAGCUCUACAAUAUUGAUAGUCAUUUGCUGCUCUCUGUUUUACCCCAGCUUGAAUUUAAAUUAAAGAGCAAUGAUAAUGAGGAGCGCCUACAAGUUGUUAAACUACUGGCAAAAAUGUUUGGGGCAAAGGAUUCAGAAUUGGCUUCUCAAAACAAGCCACUUUGGCAGUGCUACUUGGGCAGGUUUAAUGAUAUCCAUGUACCAAUCCGCCUGGAAUGUGUGAAAUUUGCUAGCCAUUGUCUCAUGAACCAUCCUGAUUUAGCAAAAGACUUAACAGAGUAUCUUAAAGUGAGGUCACAUGACCCUGAGGAAGCUAUUAGACAUGAUGUUAUUGUGUCAAUAGUUACAGCUGCUAAAAAGGAUAUUCUUCUGGUCAAUGAUCACUUACUUAAUUUUGUGAGAGAGAGAACAUUAGACAAACGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-211.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -228.66
Frequency: 0.0000
Diversity: 223.09
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((......(((((......)))))((((((((((((...(....)....))))).)..)))))).((((........))))((((((((((((((((.(((((.(((((...))))).))))).)))......)))))))...))))))((((((.((.((((((((..((((((((..........((((....(((((.....(((((((.(.((.((((.(((((((((..((((((((....))))))))..(((((.((((....)))))))))(((.((((.....)))).))).)))))))))..))))..)).)...))))))).)))))....))))..)))))))).....((((((....))))))........................)))))))))))).))))........))))..((.((((((.(((((.((...(((((((((.(((........))).))))..)))))...)))))))((((((((.(((((((((..(((...(((.......)))...)))...))))(((....((((....))))...))).........))))).))))....))))..((((((........))))))....(((((((((.....(((((((((....(((((((.((........)).))).))))...))))))))))).)))))))((((..((((((((..(((((((....((((....)))).((((..((...((((....)))))).))))(((((((.((((((((...))))))))))))))).....))))))).))))........))))..))))((.(((((........))))).))..........)))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({(.,,...(((({......||}||(((({,{(((((...{....)....))))).}..}||}}|{((((........))))||{{{{((((((((((.(((((.(((({...|)))),|}})).}}},.....|))))))...|||||.(({(((.((.((((((((..((((((((..........{(((,...{{,...{{(,{((((((.{.((.((((.(((((((((..((((((((....))))))))..(((((.((({....}))))))))(((.((((.....)))).))).)))))))))..))))..)).}...))))))))))))),...))})..)))))))).....((((((....))))))........................))))))))))))),))),,,,,},,))))..{{.{{{{{||({((|,{{...(((((({((.(((,.,,,,,.}}}.}}}}..|}||},,.||||||||,({{(({.{{{{{((((....,...,,,,..}}}}..,,.,|||,{{|}}}{((..,.{(((,,,.}}}}..,))),,...,,}.})))),.,,|{,,,|||{..((((((........))))))....(((((((((,....{((((((((.,,.{{{((((.((........)).)))),))).,.))))))))))),})))))){{{||,|{{{((((..{((((({.,.,{(({...,)))).||||.,,,,,.((((....))))},|}},.(((((((.((((((((...))))))))))))))).}.,,))))))}.))))}..,,,,.}}||{,|||,((.((({(,,......})))).))}.},.}},,.)))}}}}),
Back