Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PDS5B_0014300
Sequence Length
1272 nt
GC Content
0.3899
UGGAGAGUACGCAAAGAAGCCAUGAUGGGACUUGCCCAAAUUUAUAAGAAAUAUGCUUUACAGUCAGCAGCUGGAAAAGAUGCUGCAAAACAGAUAGCAUGGAUCAAAGACAAAUUGCUACAUAUAUAUUAUCAAAAUAGUAUUGAUGAUCGACUACUUGUUGAACGGAUCUUUGCUCAAUACAUGGUUCCUCACAAUUUAGAAACUACAGAACGGAUGAAAUGCUUAUAUUACUUGUAUGCCACACUGGAUUUAAAUGCUGUGAAAGCAUUGAAUGAAAUGUGGAAAUGUCAAAAUCUGCUCCGACAUCAAGUAAAGGAUUUGCUUGACUUGAUUAAGCAACCCAAAACAGAUGCCAGUGUCAAGGCCAUAUUUUCAAAAGUGAUGGUUAUUACAAGAAAUUUACCUGAUCCUGGUAAGGCUCAGGAUUUCAUGAAGAAAUUCACACAGGUGUUAGAAGAUGAUGAGAAAAUAAGAAAGCAGUUAGAAGUACUUGUUAGUCCAACAUGCUCCUGCAAGCAGGCUGAAGGUUGUGUGCGUGAAAUAACUAAGAAGUUGGGCAACCCCAAACAGCCUACAAAUCCUUUCCUGGAAAUGAUCAAGUUUCUCUUGGAGAGGAUAGCACCUGUGCACAUAGAUACCGAAUCUAUCAGUGCUCUUAUUAAACAAGUGAACAAAUCAAUAGAUGGAACAGCAGAUGAUGAAGAUGAGGGUGUUCCAACUGAUCAAGCCAUCAGAGCAGGUCUUGAACUGCUUAAGGUACUCUCAUUUACACAUCCCAUCUCAUUUCAUUCUGCUGAAACAUUUGAAUCAUUACUGGCUUGUCUGAAAAUGGAUGAUGAAAAAGUAGCAGAAGCUGCACUACAAAUUUUCAAAAACACAGGAAGCAAAAUUGAAGAGGAUUUUCCACACAUCAGAUCAGCCUUGCUUCCUGUUUUACAUCACAAAUCUAAAAAAGGACCCCCCCGUCAAGCCAAAUAUGCCAUUCAUUGUAUCCAUGCGAUAUUUUCUAGUAAAGAGACCCAGUUUGCACAGAUAUUUGAGCCUCUGCAUAAGAGCCUAGAUCCAAGCAACCUGGAACAUCUCAUAACACCAUUGGUUACUAUUGGUCAUAUUGCUCUCCUUGCACCUGAUCAAUUUGCUGCUCCUUUGAAAUCUUUGGUAGCUACUUUCAUUGUGAAAGAUCUUCUCAUGAAUGAUCGGCUUCCAGGGAAAAAGACAACUAAACUUUGGGUUCCAGAUGAAGAAGUAUCUCCUGAGACAAUGGUCAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-315.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -341.34
Frequency: 0.0000
Diversity: 320.61
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((.(((((......)).....((((.....)))).........((..((((((.........(((((..........))))).........))))))..)).........(((((.(((..(((((((....)))))))..))).(((((.....)))))..((((((..((((......(((((.((........)).))))).............((((........((((((.((((((((..((((((.((((.....))))))))))(((((((((..(((((............)))))((((((((...)))))))).((((((...(((.(........).)))....)))))).)))))))))....)))).))))...)))))).....((((.......))))((((((((((((((.....)))))))..(((((((((.....(((.((.((.((((((...((........)).))))))..)))).)))(((......)))((((((..((((((.........))))))......(((((....))))).))))))....(((((((((.((((((......))))))...))))))))))))))))))((((((((((.....))))))..))))..(((((.....)))))...........((((...(((((((((((((.((((.((((((......(((....(((....((((((........))))))..)))....))).....)))))))))))))..))).)))))))...))))((((((((...(((((((.(......(((((((((.(((.(((((....)))))...................(((((((((((..((((.(((((...))).....))...))))..)))))))))))))).)))))....)))).....((......))).)))))))...)))..)))))..(((((..(((((..((((((.....)))))...)..)))))..))))).)))))))..))))..))))..)))))).))))).(((((((............((..((.....((((((((...(((.......)))..))))))))........))..))...(((((((.((((..(((((...)))))(((((((....))).)))))))).))))))).........((((...)))))))))))........))))))))...(((....)))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((.(((((......}|,,,..((((.....)))}...,,....({..((((((......,..(((((..........))))).........))))))..}}.........,{{{{.(((..(((((((....)))))))..))).(((((.....)))))..((((((..((((....,,{(({{,{{,.......||.,,,,,..,...,{{{{,,,{{,.,,.,{{.((((({.{((((({(..(((({((((((.....)))))))))){{{{|||||..,((((............))))|((((((({...,)))))))}((((((...(((.{........}.)))....)))))),}}||}||}},...)))).))))...}}}}}|,|||...(((((.(((....))).)))))|||||.,{{,,,,,))),,(((((((((,....{((.{{.{{.{(((((...((........}}.))))}}..}}}).)}){|},,,|,..,}|||{((.,((((((.,,.,,....|||||....,}}||,|..,}},}}.,)))))).,..{((((((((.((((((......))))))...))))))))))))))))))((((((((((.....))))))..))))..,,........}}|||.....,,...{((((...((((((((((((,{((((.((((((...,,.(((....(((....((((((........))))))..)))....))).,...)))))))))))))..))),}))))))...)))))||{|{{|...(((((((.(,.....{((((({((,{{,.(((((,...}))))...................(((((((((((..((((.{{{((...,,,.....))...))))..)))))))))))})}.)))),....}}},.....{(......},).)))))))..,)}),.,}})},,{(({{..{{|{{..{{{(((.....})))).,,|,.||||}..|}}}}.}}}|}||,|},,...))))..)))))).})))}.||||{{{.,,,.......,|,..|||,...((((((((...(((.......)))..))))))))..},,|,,,|,,|,...(((((((.((((..,{(((,,,|||},{{,,{|{.,,,))).))},)))).)))))))...,,....,,,...,})))))))))),,,.....))))))))...(((....)))...
Back