Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PDS5B_0015200
Sequence Length
351 nt
GC Content
0.2621
GGAUGGGUACAGGUUUUACGUUCCAUUUUCAUAUACUGUAUUUGAACAGUCAUAUCUAAAAAUAGGUAUGUGUAAUAGUUAUAAUUUUAGUUCAUAGGUAAUUGUGUUACAAGGAUCUUCAUUAAUUUUUUUCAAAGAAAACUUUAAAAAGCUGUUGAAUUUUACACAUUUAAAAACAAUUUCUACUGAAGGCUAAAAAACAGUUUAUAAAUUUAUAUAAAAAACACAUUAUCUGAAUAUAAUCUUAAUAUUUUUUCCAUUCCAGGCUAAGAUUAGAUCUUGUAUGGACUGCAGUCAUUUAUUAGUUAAUAGAGCUCUAAAUCCUGCUUAUAGUCUGAAAUGAUUUGAUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-46.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -57.86
Frequency: 0.0000
Diversity: 114.53
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.............)))))((((.((((..(((((......)))))((((((((....)))))))).(((..((...(((((((((((...(((((((.(((((.............((((..(((((....)))))..)))).((((((((...(((((..(.((((..............)))))..)))))))))))))................))))))))))))((((((.......))))))...........)))))))))))...))..)))(((((((((..(((((..((((.....)))).))))).))))....)))))...))))...))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((.{{.{......)))))))))},.....(((((......)))))((((((((....)))))))).,.,,..,{{{,.,{{,{,((((,.{((((({{(((((....,,...,{{,.,,..,{((({.,{{|,,..}})}}}}|||{{(({,..{{{{{......||,......,,||...})))},,},,,,,}}}}||{{{{......}}}},..)))))))))))))))),,}},..}}}},......,{{,{{((,(({({{{{,,,})))}),,)))){|{{(((((((,.{((({{..,.{(((..........)))).}}}.))))))))))}}),},)
Back