Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PDS5B_0015400
Sequence Length
768 nt
GC Content
0.3867
ACUACUUGUUGAACGGAUCUUUGCUCAAUACAUGGUUCCUCACAAUUUAGAAACUACAGAACGGAUGAAAUGCUUAUAUUACUUGUAUGCCACACUGGAUUUAAAUGCUGUGAAAGCAUUGAAUGAAAUGUGGAAAUGUCAAAAUCUGCUCCGACAUCAAGUAAAGGAUUUGCUUGACUUGAUUAAGCAACCCAAAACAGAUGCCAGUGUCAAGGCCAUAUUUUCAAAAGUGAUGGUUAUUACAAGAAAUUUACCUGAUCCUGGUAAGGCUCAGGAUUUCAUGAAGAAAUUCACACAGGUGUUAGAAGAUGAUGAGAAAAUAAGAAAGCAGUUAGAAGUACUUGUUAGUCCAACAUGCUCCUGCAAGCAGGCUGAAGGUUGUGUGCGUGAAAUAACUAAGAAGUUGGGCAACCCCAAACAGCCUACAAAUCCUUUCCUGGAAAUGAUCAAGUUUCUCUUGGAGAGGAUAGCACCUGUGCACAUAGAUACCGAAUCUAUCAGUGCUCUUAUUAAACAAGUGAACAAAUCAAUAGAUGGAACAGCAGAUGAUGAAGAUGAGGGUGUUCCAACUGAUCAAGCCAUCAGAGCAGGUCUUGAACUGCUUAAGGUACUCUCAUUUACACAUCCCAUCUCAUUUCAUUCUGCUGAAACAUUUGAAUCAUUACUGGCUUGUCUGAAAAUGGAUGAUGAAAAAGUAGCAGAAGCUGCACUACAAAUUUUCAAAAACACAGGAAGCAAAAUUGAAGAGGAUUUUCCACACAUCAGAUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-189.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -206.70
Frequency: 0.0000
Diversity: 160.40
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((...(((.(((..(((((((..(((((...((.(((((..............(((((.....((((.....)))).....)))))..(((((....((((((.((((.....))))))))))....))))).............((((.....(((((((.(((......))).)))))))..))))..(((...((((((((((((....((((((((((....)))).)))))).......(((((...(((((.(((....))).)))))))))).((((....)))).(((((((((.....(((.((.((.((((((...((........)).))))))..)))).)))(((......)))((((((..((((((.........))))))......(((((....))))).))))))....(((((((((.((((((......))))))...))))))))))))))))))((((((((((.....))))))..))))..(((((.....))))).........((((((...(((((((((((((.((((.((((((......(((....(((....((((((........))))))..)))....))).....)))))))))))))..))).)))))))...))))))......)))))))..)))))....)))....(((((((((.((((...))))))).....)))))).......))))).))..))))).)))))))))).)))....))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,,...(((.({,.{(((((((..(((((...((.(((((.....,,,.{,.....,,......,{{,..{,,,||,,,,.,{||||..(((((.,..(((({((((((.....))))))))))..,.)))))..,{{{{.......,.,..}}}|{(((((,{{{...,}})))}}}}}}}},,}}}|..({{...((((((((((({,.,.{(((((((({....})))},))))}...,,..(((((...(((((.(((....))).)))))))))).{(({....)))},(((((((((,....{{{.((.{{.{{((((...((........}}.)))))}..)}}).))){|},,,|,..,}|||{((.,((((((.,,.,,....|||||....,}}||,|,.}}),}}.,)))))).,..{((((((((.((((((......))))))...))))))))))))))))))((((((((((.....))))))..))))..,.........,}|||.....,,..,(((((...((((((((((((,{((((.((((((...,,.(((....(((....((((((........))))))..)))....))).,...)))))))))))))..))),}))))))...))))))......}))))))..)))))....}))....{{{{{{,(({(({{..,)))),,}.....}))))}.......))))).))..))))).)))))))})).}}),,..}}...
Back