Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PDS5B_0015700
Sequence Length
607 nt
GC Content
0.3937
ACUACUUGUUGAACGGAUCUUUGCUCAAUACAUGGUUCCUCACAAUUUAGAAACUACAGAACGGAUGAAAUGCUUAUAUUACUUGUAUGCCACACUGGAUUUAAAUGCUGUGAAAGCAUUGAAUGAAAUGUGGAAAUGUCAAAAUCUGCUCCGACAUCAAGUAAAGGAUUUGCUUGACUUGAUUAAGCAACCCAAAACAGAUGCCAGUGUCAAGGCCAUAUUUUCAAAAGUGAUGGUUAUUACAAGAAAUUUACCUGAUCCUGGUAAGGCUCAGGAUUUCAUGAAGAAAUUCACACAGGUGUUAGAAGAUGAUGAGAAAAUAAGAAAGCAGUUAGAAGUACUUGUUAGUCCAACAUGCUCCUGCAAGCAGGCUGAAGGUUGUGUGCGUGAAAUAACUAAGAAGUUGGGCAACCCCAAACAGCCUACAAAUCCUUUCCUGGAAAUGAUCAAGUUUCUCUUGGAGAGGAUAGCACCUGUGCACAUAGAUACCGAAUCUAUCAGUGCUCUUAUUAAACAAGUGAACAAAUCAAUAGAUGGAACAGCAGAUGAUGAAGAUGAGGGUGUUCCAACUGAUCAAGCCAUCAGAGCAGGUCUUGAACUGCUUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-146.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -159.19
Frequency: 0.0000
Diversity: 144.08
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((..((((((.(((....))).))))))..))))(..........................((((....((((...((((((((...(((((....((((((.((((.....))))))))))....)))))..(((((............)))))((((((((...)))))))).((((((...(((.(........).)))....))))))(((((((((....)))).)))))........(((((...(((((.(((....))).)))))))))).((((....)))).(((((((((.....(((.((.((.((((((...((........)).))))))..)))).)))(((......)))((((((..((((((.........))))))......(((((....))))).))))))....(((((((((.((((((......))))))...))))))))))))))))))((((((((((.....))))))..)))).........)))))))).........(((.(((((((.(...(.((....)).).).))))))).)))...)))))))).((((((........))))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((..((((((.(({....,}).))))))..}))}{,,{,........,.............,{{{,,,,,.,,,.,{{.((((({.{((((({{..(((({((((((.....)))))))))){{{{|||||..,((((............))))|((((((({...})))))))}((((((...(((.{........).)))....)))))),||||}||}}....)))).))))...}}}}}|,|||...(((((.(((....))).)))))))))).|(({....)))},(((((((((,....{{{.((.{{.{{((((...((........}}.)))))}..)}}).))){|},,,|,..,}|||{((.,((((((.,,.,,....|||||....,}}||,|,.}}),}}.,)))))).,..{((((((((.((((((......))))))...))))))))))))))))))((((((((((.....))))))..)))).........,,,})))}.....||....|,{((((((.(...{.,{....)).,.).))))))}.||{{{......)))}|(((((........)))))}..)
Back