Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PDS5B_0021400
Sequence Length
267 nt
GC Content
0.3783
UGCUCUUAUUAAACAAGUGAACAAAUCAAUAGAUGGAACAGCAGAUGAUGAAGAUGAGGGUGUUCCAACUGAUCAAGCCAUCAGAGCAGGUCUUGAACUGCUUAAGGUACUCUCAUUUACACAUCCCAUCUCAUUUCAUUCUGCUGAAACAUUUGAAUCAUUACUGGCUUGUCUGAAAAUGGAUGAUGAAAAAGUAGCAGAAGCUGCACUACAAAUUUUCAAAAACACAGGAAGCAAAAUUGAAGAGGAUUUUCCACACAUCAGAUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-58.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -63.36
Frequency: 0.0002
Diversity: 52.64
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((...........(((((.....(((...((((...(((((((((((((.((((.((((((......(((....(((....((((((........))))))..)))....))).....)))))))))))))..))).)))))))...)))))))....))))))))..((((((...((((.(((......(((((....)))))........(((((((.................)))))))..))).))))....)))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
{((({{,.,,..{(((((.{.........{(((((...((((((((((((,{((((.((((((...,,.(((....(((....((((((........))))))..)))....))).,...)))))))))))))..))),}))))))...)))))).....,,..}.)))))|,|||...{{{,.,.({,,,,.(({((,,..})))).,}.....}}}}}}.......,}},,))}...{({{.{.(({...)))...,.)))).}.
Back