Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PDS5B_0025800
Sequence Length
782 nt
GC Content
0.3862
GAUGAAUGCUAUCAAGUAAGACAAGUGUUUGCCCAGAAACUUCACAAAGGCCUUUCCCGUUUACGGCUUCCACUUGAGUAUAUGGCAAUCUGUGCCCUUUGUGCAAAAGAUCCUGUAAAGGAGAGAAGAGCUCAUGCUAGGCAAUGUUUGGUGAAAAAUAUAAAUGUAAGGCGGGAGUAUCUGAAGCAGCAUGCAGCUGUUAGUGAAAAAUUAUUGUCUCUUCUACCAGAGUAUGUUGUUCCAUAUACAAUUCACCUUUUGGCACAUGACCCAGAUUAUGUCAAAGUACAGGAUAUUGAACAACUUAAAGAUGUUAAAGAAUGUCUUUGGUUUGUUCUGGAAAUAUUAAUGGCUAAAAAUGAAAAUAACAGUCACGCUUUUAUCAGAAAGAUGGUAGAAAAUAUUAAACAAACAAAAGAUGCCCAAGGACCAGAUGAUGCAAAAAUGAAUGAAAAACUGUACACUGUGUGUGAUGUUGCCAUGAAUAUCAUCAUGUCAAAGAGUACUACAUACAGUUUGGAAUCUCCUAAAGACCCGGUACUACCAGCUCGUUUCUUCACUCAACCUGACAAGAAUUUCAGUAACACCAAAAAUUAUCUGCCUCCUGAAAUGAAAUCAUUUUUCACUCCUGGAAAACCUAAAACAACCAAUGUUCUAGGAGCUGUUAACAAGCCACUUUCAUCAGCAGGCAAGCAAUCUCAGACCAAAUCAUCACGAAUGGAAACUGUAAGCAAUGCAAGCAGCAGCUCAAAUCCAAGCUCUCCUGGAAGAAUAAAGGGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-167.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -182.54
Frequency: 0.0000
Diversity: 238.93
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((..((((....))))...((((((...(((...((((..................))))..)))...)))))).(((((.((((.....))))...)))))......((((....))))((...(((((..((((..(((.((((((((((((...........((((.(((.((((.((.((((((((((..(((.(((.((............))..))).))).)))))))))).)).))))..))).)))).((((((((((......))))))...(((....((((((((((((.(((((((((((....))))))))))).))))))....))))))....)))...........((((((......((((((((......))))))))..........................((((.((((((((.......(((.((((((((.....((((((((((.(((((.(((((......))))).)))....)).))))))))))..(((...)))....((.(.(((...))).).)))))).)))).)))..((((........))))...........))))))))..))))((((((....))))))...(((((((((..................)))))))))))))))....)))).))))))))((......)).....(((.(((..((.....)).)))...)))..)))).))).))))..)))))...))))..(((((((..........)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{.{(,.((((.,,.,}},.||,.,||||||(({..,,..,........}}},{{{{{{,(((({{{|{(({{{{{,.(((({.((((.....))))...}))))..}}},,{{|,,,.||||{{{..(((((,.((((..(((.((((((((({{{.,,,....,|,,{((,{((.((((.((.((((((((((..(((.(((.({..........,.})..))).))).)))))))))}.)).))))..}}}.}}}|{((({({{(({......}}})))}},,,||||,|||{{{((((((.(((((((((((....))))))))))).))))))....,}}}}}..{((((.....,.....{,,,||},,...((((((((......))))))))....................,,,...{(({.((((((((.......{{{.{({{{{{{|||,.{(((((((((.{.(((.(((((......))))).)))....},,)))))))))),,((,...}})....{{.,.(({...})).},,}}}}},}}}}.}},..((({........))))...........}})}}}}|,,|}||{{,,(({{{.,,,|}}}||(((((((({.................,)))))))))|}},,,...}))},.})))))))||}}}},.}}.....{{{.{{{..{{.....)}.)))...))),,)))}.))).))))..))))).....},..|||{{{|,,,.,..,,,)))))))
Back