Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PDS5B_0027000
Sequence Length
341 nt
GC Content
0.4340
GAUGAAUGCUAUCAAGUAAGACAAGUGUUUGCCCAGAAACUUCACAAAGGCCUUUCCCGUUUACGGCUUCCACUUGAGUAUAUGGCAAUCUGUGCCCUUUGUGCAAAAGAUCCUGUAAAGGAGAGAAGAGCUCAUGCUAGGCAAUGUUUGGUGAAAAAUAUAAAUGUAAGGCGGGAGUAUCUGAAGCAGCAUGCAGCUGUUAGUGCCGUGUAGGACGCUCCAAACAAGCAGCUACUAAGGAAAAUGAUUCAAGUGAAGAAGUAGAUGUGUUUCAGGGUAGCUCUCCUGUCGAUGAUAUUCCACAGGAAGAAACAGAGGAGGAGGAAGUUUCUACAGUAAAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-84.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -90.16
Frequency: 0.0001
Diversity: 65.36
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.....((((....)))).......)((((((..(((((((((.......((((...(((((((..((((.((((((((....((((.....))))((((.....)))).((((....)))).......((((.((((..(((((((((......))))))...)))..)))).)))).(((..((.(((.(((...((((((((((.....)).))))...)))).)))))).))..))).....))))))))))))..)))))))((((((.(((...)))((((((.((......)).)))))).)))))))))).....)))))))))...))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{.{,..((((....))))...,,..}((((((..(((((((((.......((((,..(((((((..(((,{((((((((.{{,((((.....)))){{{{..,,.}})).((((....))))....,,,((((.((((..(((((((((......))))))...)))..)))).)))).))}..{(((((.,||.||||||{(({((..,,.}}.}}}}....,,.,))}))).},..,,......))))))))))))..))))))),{{{{{,{{{...}}|((((((.((......)).)))))).))})))}})),,,.,)))))))))...))))))
Back