Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_PHKA2_0003200

Sequence Length

495 nt

GC Content

0.5414

GCUGGUCUCGAAAUCCCGGCCUCAGGUGAUCUGCCCGCCUCGGCCUCCCAAAGUGCUGGAAUUACAGGUGUGAGCCACCGCGCCUGGCCGGGUAUGUUUUAUUAGAAUAAUUUUUUACUUAUCCAAAAGCAAGGGUGGGCACGGUGGUUCAUGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCUGAGGCGGGCAGAUCGCUUGAGCCCAGGAGCUCAAGACCAGCCUGGGCAACAUGGCAAAACCCUGUCUUCACAAAACAUACAAAAAAUUAGCCAGGUAUGGUGGCGCACACCUGUGGUCCUAGCUACUUGGGAGGCUGAAGCGGAAGGAUCGCCUGAGCCCAGGAGGCAGAGGUUGCAGUGAGCCAAGAUCGCACACUCCAGCCUCGGGAACAGAGCAAGACUCUGUCUCAAAAAAAAUAAAAAAACAUGGCUGGUUGCAGUGGCUCACGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGUCAAGGUGGGCGGAUCACAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-256.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -262.03

Frequency: 0.0001

Diversity: 55.46

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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