Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PHKA2_0004300
Sequence Length
460 nt
GC Content
0.5217
UUGUUCCCAUGACUUUGCCGACUAAAGUUCUAAGUGCCCACCGUAAAUCACUGAAUCUUGUUGAUUCUCCUCAGCCACUCCUAGAAAAGGUUCCUGAAAGUGACUUUCAGUGGCCCAGAGAUGACCAUGGUGACGUGGACUGUGAGAAGCUGGUUGAGCAGCUAAAAGAUUGUUCGAACCUACAGGACCAAGCAGACAUUCUGUACAUUCUUUAUGUCAUAAAGGGUCCCAGCUGGGACACAAAUCUCUCUGGACAGCACGGGGUCACCGUUCAAAACCUUCUUGGUGAGCUCUAUGGGAAAGCCGGCUUGAACCAGGAGUGGGGUCUGAUUCGCUACAUCUCAGGCCUUCUCAGGAAGAAAGUGGAGGUCCUGGCUGAGGCCUGCACAGACCUGCUUUCGCACCAGAAGCAGCUCACCGUGGGCCUGCCGCCCGAGCCCCGGGAGAAGAUCAUCUCUGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-142.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -152.31
Frequency: 0.0000
Diversity: 152.48
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((((...(((((((.....)))))))...((((............))))(((((.....))))).......((((((((......((((((((((((...)))))))....(((((((.(((((((....))))).(((((.......((((((((((((...)).)))))).)))))))))......(((((...)))))....(((((((...)))))))(((((....))))).....)))))))))..(((.(((.....((((.....(((.....))).......)))).....)))))).)))))))))))))(((((((...........)))))))......))))..))((((((((..((((..((((((((...((.(((((((.......))))))).))...))))))))))))((((.....))))........))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({.{((({{,(((((((.....))))))}...{((({,,,,.,....,||||(((((.....)))))...,,,{{{{{{({{.,...|||{{.|{(({|(|||||||}.||||.(((((((.({(({({.,,,|}}}}.{((((....,,.(((((((((({{...,}.))))))}}}))}}}}},,....(((({...)))))....,{{{{||,,,))}}}))(((((....))))).....}})))))))...})}}|||}||||{,,,,,.,,}},,.,}))}|||||}.,}||}},,,|}|||||,.,||,}||||||(((((((...........)))))))},|},.))}}..},{{({{(({.{,(((.,{(((((((...((.((((((({......))))))).))...)))))))),},}||{|.}},,))||{{,.....,)))))))
Back