Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PHKA2_0004400
Sequence Length
380 nt
GC Content
0.4921
UUGUUCCCAUGACUUUGCCGACUAAAGUUCUAAGUGCCCACCGUAAAUCACUGAAUCUUGUUGAUUCUCCUCAGCCACUCCUAGAAAAGGUUCCUGAAAGUGACUUUCAGUGGCCCAGAGAUGACCAUGGUGACGUGGACUGUGAGAAGCUGGUUGAGCAGCUAAAAGAUUGUUCGAACCUACAGGACCAAGCAGACAUUCUGUACAUUCUUUAUGUCAUAAAGGGUCCCAGCUGGGACACAAAUCUCUCUGGACAGCACGGGGUCACCGUUCAAAACCUUCUUGGUGAGCUCUAUGGGAAAGCCGGCUUGAACCAGGAGUGGGGUCUGAUUCGCUACAUCUCAGGCCUUCUCAGGAAGAAAGUGGAGGUCCUGGCUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-110.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -117.16
Frequency: 0.0000
Diversity: 99.26
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..........(((((((.....)))))))...((((............))))(((((.....)))))..((((((((((((.........(((((((..((((((((..(((..(((((((.(((((((....))))).(((((.......((((((((((((...)).)))))).)))))))))......(((((...)))))....(((((((...)))))))(((((....))))).....)))))))))....))))))))))).........(((((((((((((((....((.....)))))))..)))))))).))(((((((...........)))))))...)))))))......))))....))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,,.....,.{((((((.....})))))}...{(((............}))}(((((.....)))))..(((((((({{(({.......,(((((((..(((((({{..(({,.(((((((.({(({({.,,,|}||}.{((((....,..(((((((((({{...,}.))))))}}}))}}}}},.....(((({...)))))....,{{{{||,,,))}}}))(((((....))))).....}))))))))...,)}}}))))))).........{{{{(((((((((({....((.....)))))))..)))))))).}|(((((((...........))))))),,.)))))))......}}))}...))))))))
Back