Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PHKA2_0006900
Sequence Length
1429 nt
GC Content
0.4878
GUGGCCAAAGUGGAGAAGUUCAAACACACUCAGAGCACCAAGGACAGCCUGCACGCCAAGUACAACACCGCCACCUGUGGCACGGUGGUGGGCGACGACCAGUGGGGCCACCUCCAGGUGGAUGCCACCUCUCUCUUCCUCCUGUUCCUGGCCCAGAUGACCGCCUCAGGCUUACGUAUCAUUUUCACUCUCGAUGAGGUGGCCUUCAUACAGAAUCUUGUCUUUUACAUAGAAGCUGCAUAUAAAGUCGCUGAUUAUGGAAUGUGGGAGCGUGGAGAUAAGACUAAUCAGGGCAUCCCGGAAUUGAAUGCAAGCUCCGUAGGAAUGGCCAAGGCAGCUCUUGAGGCAAUUGAUGAACUGGACCUUUUUGGAGCCCAUGGAGGACGCAAGUCAGUGAUUCAUGUUCUGCCAGAUGAGGUCGAGCACUGCCAGUCUAUUCUGUUCUCCAUGCUGCCAAGAGCGUCGACAUCUAAAGAAAUUGAUGCUGGACUUCUUUCCAUUAUUUCCUUCCCGGCCUUUGCAGUGGAAGAUGUAAACCUUGUAAAUGUGACCAAAAAUGAAAUUAUUUCUAAGCUCCAGGGGCGUUAUGGAUGCUGUCGCUUCCUUCGAGAUGGUUAUAAAACUCCAAGAGAGGACCCUAAUCGACUGCAUUAUGACCCUGCUGAACUCAAGCUCUUCGAAAACAUUGAAUGUGAGUGGCCUGUGUUUUGGACAUAUUUUAUAAUAGAUGGAGUCUUCAGUGGUGAUGCUGUUCAGGUCCAAGAAUACCGAGAGGCCCUGGAGGGAAUACUCAUCAGAGGCAAGAAUGGGAUCCGCCUGGUGCCUGAACUCUACGCUGUCCCGCCUAACAAGGUAGAUGAAGAGUACAAGAAUCCUCACACAGUAGACCGAGUUCCUAUGGGGAAGGUGCCUCAUCUGUGGGGCCAAUCCUUGUACAUCCUCAGCUCGCUGUUGGCAGAGGGAUUCCUUGCCGCUGGUGAAAUCGAUCCCUUAAAUAGAAGAUUUUCCACUUCAGUCAAACCUGAUGUUGUAGUACAAGUUACUGUUUUGGCAGAAAACAAUCACAUUAAGGACUUAUUGAGGAAACACGGGGUGAACGUCCAGAGUAUCGCGGACAUUCAUCCAAUUCAAGUCCAGCCGGGCCGGAUUCUUAGUCACAUAUAUGCCAAGCUUGGACGGAAUAAGAAUAUGAAUUUGAGUGGGCGACCGUAUCGACAUAUUGGUGUCCUUGGAACCUCUAAACUAUAUGUGAUUAGGAACCAAAUCUUUACUUUUACACCCCAGUUCACCGACCAGCAUCACUUCUACCUGGCCCUCGACAAUGAGAUGAUCGUGGAGAUGCUAAGGAUCGAGCUGGCCUACCUGUGCACCUGCUGGAGGAUGACGGGCAGACCCACACUCACCUUCCCCAUCAGUCGCACCAUGCUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-427.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -456.07
Frequency: 0.0000
Diversity: 371.15
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...((((((((((.((((.....(((..((((..(((((((((.((..(((.....((......((((((((........))))))))...)).....)))((((((....((((.(((..............))).))))....)))))).((((...(((...))).....))))..........((((((.(((.((((.(...((((.((...((((........((((((((((((..((.(((((....((((..(((.((((((((((..(((.((..(..(((((((((((.(((....)))..))))..))).((.(((((......)))).).)).........((.(((((((((((((..((((((..((........))..))))))..)).))))).)))))).))...)))).)..)).)))..)))))))))).)))..((((((((..((....))..))))))))(((......))).....))))...(((((((..((((((((((((.(....((((.(((((....((....))....))))).))))...(((.((.((((((.((((.(((((((((((.(((.(........).))).))).))))........)))).)))))))))).)).))).(((((.....(((((.....)))))..)))))((((((((((((((((..(((((((.....)))))))...(((((....))))).....)))).)))))))....)))))...((((((....(((((((.(((((....(((((((..(((((((((....(((((..(((........)))..)))))...)).))))........(((.(((((((.(.(((....((((((((..(.((((((....)))))))..))))))))....))).))).)))))))))))..)))))))))))).)))))))......)))))).......).))))))))))((((......))))(((......)))......((((((.....))))))..........(((((...((((........(((((((.((((.((...))..)))).)))))))..))))))))).)).)))))))....))))).)).)))))))..))))).........))))....)).)))).).)))).))).))))))......)))))))))))...)))).........))).....))))....))))))))))..))).(((((((.((....((((((...(((((......(((......)))......)))))))))))..))...))))))).......((((..(((.(((.((((((.(((....)))....)))...)))))).)))..))))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((...((((((((((.((((...{{((,..((((..(((((((({,((,,,{(,,...||......((((((((........))))))))|,.,,...,,|||((((((....((((.(((..............))).))))....)))))).{(({,.,(({...))).....},}}..........((((((.(((.((({.(,{.((((.((.{{((((...{....((((((((((((..({.({(((,,{.((({,.(((.((((((((((..(((.{,....((.(((((((((.(((....)))..))))..))},)).))..(((((,{{,|,,|.|,..,...,..((.(((((((((((((..((((((..((........))..))))))..)).))))).)))))).))..})))).}..},.)))..)))))))))).)))..((((((((..((....))..))))))))(({......))),.....{{{..{(((((,{.,({((((((((((.{....{{((,{((((,,.,{{....,|,...}}})),}}}}...(((,((.((((({{((((.(((((((((((.(((.{........}.))).))).))))........)))).)))))))))),)).))).(((((.,,..(((((.....))))).,)))))((((((((((((((((.,|{{||||,...||||||}|{,.(({{{.,,,,}))),,,,,)))))})}})))....))))){{{((((((....(((((((.((((({...{(({{({..,|||,||||,.{{(((,{,,{((,..{{{,.,},,}))})}}|.))|))|}..(,{{{{((,{(((((,(,{.(((....((((((((.,(.((({(,....}))))))..))))))))....})).}}),)))))}),},},})))))))))))).)))))))......)))))}....,,.}.)))))))))){({(,.....}))},{{,{{.,.}},.,,},|{(({{{.,,..}}}})}...,,,....(((((...{({(........(((((((.((((.(,...,)..)))).)))))))..))))))))).))}))),,)))}}}))))),)).)))))))..)))))....,,...)))},}}.)).)))).),)))).))).))))))......)))))))))))...))))........}))).,,..))))....))))))))))..}}}.(((((((.{(,,,,((((((...(((((......(((......)))......)))))))))))..)).,,))))))).......((((..(((.(((.(({(({.(((....)))....))).,,)))))).)))..))))........
Back