Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PHKA2_0008500
Sequence Length
432 nt
GC Content
0.5301
GUGGCCAAAGUGGAGAAGUUCAAACACACUCAGAGCACCAAGGACAGCCUGCACGCCAAGUACAACACCGCCACCUGUGGCACGGUGGUGGGCGACGACCAGUGGGGCCACCUCCAGGUGGAUGCCACCUCUCUCUUCCUCCUGUUCCUGGCCCAGAUGACCGCCUCAGGCUUACGUAUCAUUUUCACUCUCGAUGAGGUGGCCUUCAUACAGAAUCUUGUCUUUUACAUAGAAGCUGCAUAUAAAGUCGCUGAUUAUGGAAUGUGGGAGCGUGGAGAUAAGACUAAUCAGGGCAUCCCGGAAUUGAAUGCAAGCUCCGUAGGAAUGGCCAAGGCAGCUCUUGAGGCAAUUGAUGAACUGGACCUUUUUGGAGCCCAUGGAGGACGCAAGUCAGUGAUUCAUGUUCUGCCAGAUGAGGUCGAGCACUGCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-129.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -136.85
Frequency: 0.0000
Diversity: 110.11
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((..(.(((....((((...........))))....(((....)))...((((........(((((((.((...))...)))))))))))....))).)..))))))((...(((((.((((((((((((((.(((((((((((.....(((.((((......(((((..(.((((............)))).)..))))).....(((..((((((.....))).)))..)))........))))))).....)))))..))))).).)))))............((.(((((((((.(((....)))..))))..)).))).))..(((((..(.((((...((((((....((..(((((.(((...))).))))).))...))))))..)))).)..)))))....))))).).))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((..(.(((....(({{...........|,||....(((....))),..{||,..,,......((((((((........))))))))}},.,..))).)..))))))((...(((((.((((((((((((((,,((((((((((,{{,,,,(,,{,{,{{{|{{|||,..,,{.,,.....,,{.....,})})|||||,||.{{.(((..((((((.....))).)))..)))..,.....))))))}.,,}}))}}}}}))))))).)))),..,},.......((.(((((((((.(((....)))..))))..))},)).))..(((((..(.((((.,.((((((....{{,.(((((.(((...))).})))).),...))))))..)))).)..))))),}}.))))).).))))))))))
Back