Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_PIP5K1A_0000700

Sequence Length

384 nt

GC Content

0.4792

GUGAGCAAAGGAAGUUGGCGAGAGGGAAUGAGAAGAGGGUUUUUUGUUCUUGUUUGUUUGUUUUUAGGAUAUUUAAUUAGAGUAUAUUAAUACUUUUUUUGUUUUGUUUUGUUUUGUUUUUUGAGGCGGAGUUUCACUCUUUUGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGUGGGAUCUCAGCUCUCUGCAACCUCCACCUCCCGGGUUGAAGCGAUUCACCAGCCUCAGCCUCCCAAGAAGCUGGGACUACAGGCACGUGCCACCACAUCCGGCUAAUUUUUGUACUUUCAGUAGAGACAGGGUUUCACCAUGCUGGCCAGGCUGGUCUCUAACCCCUGACCUCAGGUGAUCUGCCCACCUCAGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUAUAGGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-111.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -119.15

Frequency: 0.0000

Diversity: 103.61

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((..((((((...(((((((.(((((((((((((.(((...((((((.(((....(((((...)))))...))).))))))....))).))))))))))))).)))))))...))))))(((((((.(..((...((((.(((((((.((((((((((.(.(((....))).)...)))))..))))))))...)))).)))).))..).)).)))))(((((((((......))))).....(((....))).........))))....(((.((((...)))).)))..((((.(((((.((..((.((((..(((.....))))))).)).)))))))...))))..))))((((((((......))))).....)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

.((((..{{((({...(((((((.(((((((((((((..{{..,|{||({|{|||,,.{{{{,...|})}}..,}}..|))}|},,..})}.))))))))))))).))))))}...}}}}}|(((((((.(..((...((((.(((({((.((((((((((.((({{....,),,),,.)))))..)))))}}}...)))).)))).))..).)).))))))|||{{{{{...,{{||||,.....(((....)))......}}}))))....|{(,({((...,}}),))),.((((.(((((.((..((.((((..(((.....))))))).)).)))))))...))))..))))((((((((......))))}....,)))