Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PIP5K1A_0002600
Sequence Length
1278 nt
GC Content
0.4750
CAGCAUCUGGAAUCAAGAGACCCAUGGCAUCUGAGGUCUUGGAAGCUAGACAGGAUUCUUACAUCUCAUUGGUGCCUUAUGCCUCUGGCAUGCCCAUCAAGAAAAUAGGCCAUAGAAGUGUUGAUUCCUCAGGAGAGACAACAUAUAAAAAGACAACCUCAUCAGCCUUGAAAGGUGCCAUCCAGUUAGGCAUUACCCACACUGUGGGGAGCCUGAGUACCAAACCAGAGCGUGAUGUCCUCAUGCAAGAUUUCUACGUGGUUGAGAGUAUCUUCUUUCCCAGUGAAGGGAGCAACCUGACCCCUGCUCAUCACUACAAUGACUUUCGUUUCAAGACCUAUGCACCUGUUGCCUUCCGCUACUUCCGGGAGCUAUUUGGUAUCCGGCCCGAUGAUUACUUGUAUUCCCUCUGCAGUGAGCCGCUGAUUGAACUCUGUAGCUCUGGAGCUAGUGGUUCCCUAUUCUAUGUGUCCAGCGACGAUGAGUUCAUUAUUAAGACAGUCCAACAUAAAGAGGCGGAAUUUCUGCAGAAGCUGCUUCCAGGAUACUACAUGAACCUCAACCAGAACCCUCGGACUUUGCUGCCUAAAUUCUAUGGACUGUACUGUGUGCAGGCAGGUGGCAAGAACAUUCGGAUUGUGGUGAUGAACAAUCUUUUACCAAGAUCGGUAAAAAUGCAUAUCAAAUAUGACCUCAAAGGCUCAACCUACAAACGGCGGGCUUCCCAGAAAGAGCGAGAGAAGCCUCUUCCCACAUUUAAAGACCUAGACUUCUUACAAGACAUCCCUGAUGGUCUUUUUUUGGAUGCUGACAUGUACAACGCUCUCUGUAAGACCCUGCAGCGUGACUGUUUGGUGCUGCAGAGCUUCAAGAUAAUGGAUUACAGCCUCUUGAUGUCAAUCCAUAAUAUAGAUCAUGCACAACGAGAGCCCUUAAGCAGUGAAACACAGUACUCAGUUGAUACUCGAAGACCGGCCCCCCAAAAGGCUCUGUAUUCCACAGCCAUGGAAUCCAUCCAGGGAGAGGCUCGACGGGGUGGUACCAUGGAGACUGAUGACCAUAUGGGUGGCAUCCCUGCCCGGAAUAGUAAAGGGGAAAGGCUUCUGCUUUAUAUUGGCAUCAUUGACAUUCUACAGUCUUACAGGUUUGUUAAGAAGUUGGAGCACUCUUGGAAAGCCCUGGUACAUGACGGAGACACUGUCUCAGUGCAUCGCCCAGGCUUCUACGCUGAACGGUUCCAGCGCUUCAUGUGCAACACAGUAUUUAAGAAGAUUCCCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-359.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -386.92
Frequency: 0.0000
Diversity: 368.78
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((.(((((.........((((((((((((((((((...((((.((.....)).))))...))))))..))))))..(((((...)))))(((.............))).......((((((.((((...))))...))))))..............(((((((.(((.(..((((((((((.(((((((....(((((...)))))..)))).((((((((((.(((((((((((((..(((.(((((.......((((..(((((...((((((((.(..(...(((((...((((.((..((.((((((((((((((((....)))......((.(((..(.((((((((.(((((((....(((((.(((..((((..((......))..)))).))))))))....(((((...)))))..(((((((.....(.(((((.(..((((.........))))..)))))).).....)))))))......((((((((((........((((((((..((((.((...(((.....(((............)))....)))....))))))..)).))))))........)))))))).))))).)).)).)))))))).)..)))..))))))))))))))).))...(((((((......)))))))...(((((...))))).......(((.....)))......)))))).)))))....)..).)))))))).))))).))))....(((((((..((..(((....)))..))......)))))))))))).)))..)))))...).)))))))(((((......))))).......))))))))))...(((((((.......((((.(((((.((((((.((((((((.........)))..)).))).))))))..........(((...))).((..(((((....))).))..)).((((........))))))))).))))...((.((((.....)))).)).)))))))))).)))))))))).).))).)))))))....)))))).(((....))))))))...))..((((((.(((((((.(((((...((((((.....(((........))).........))))))))))).))))).))..(((((.(((.(((...(((((.(((((...))))).)).)))...)))))))))))(((((........)))))((((..((((......))))....)))).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..{,.(((((..((..(((((({{.{,..,|}},}})}}}|}}..}},}|..(({.{{{{..,,.{({.(((((((..(((((...)))))(((.,,.......,,.))}.......((((((.((((...)))).,.))))))..............(((((((.(((.{..((((((((((.(((,(((.,,.(((,,..,|||||{{||||((((((((({{.(((((((((((((..(((.(((({.......((((..(((((...((((((((,,..,...((({{,..{{{{.{{..{(.(((((((((((((,,...,,{{{....,..,,.((((((((((((,..((((((.{((({((((((((..((((((((((.......(((({,(((.......))))))))))))..)}}.,,))}..)))))))))))}.)))))).......,,|.,,.,{{{....)))},,}}}}.,,,,....{(((((((((........(((((({{..{{{(,((...|||,.{,.(((.,.{.....|,.}}).}..}))...,))})))..}}.))))))........)))))))).))..}.)))}})))))}})),),.,...,,,))))))))))))).}}...(((((((......)))))))...(((({...})))).{{,...|||,}}..}},......))}))),}}}}}.....,.}.)))))))).))))).))))....{((((((.,(,..{{{....}}}..,,.,,,..))))))}})))).)))..))))}...}.,))))))(((((.,...,}))||,....,.))}))))))),))},}}|||......{(((((((((..,,,,,|.})},}})))}}.,,,,,},},.||,,,,.||||||,.,,,..}}.{{{...}}}.||,,||||{.,..})),},.....|({{..,.....)))}}||},.,})),}}||.((((.....))))))).}},))),))).)))))))))).}.))).))))))).....,||||((,....}})))),.,,,.{(((((.((({....}))).)))))),,,))))))).))}...,{,,..,|{{{{{,,,..))}}}))),|||||||{.,,,.{(({((((({(((...(((((.(((((...))))).)).))).,.))))))))))}{{{{{....,,,,))))){{|,..((({......}}}}....})))).))).}
Back