Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PIP5K1A_0005400
Sequence Length
404 nt
GC Content
0.4629
GAGGCUGAGACAGGAGAAUGGCGUGAAUCUGGGAGGCGAAGUUUGCAGUGAGCCGAGAUCCUGCCACUGCACUCCAGCCUGGGUAACAGAGCAAGACUCCGUCUCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAUGUUGUUCAGUUUUGUGCUUUUCACCCCAUUUCUUUUGCCUCUCUAUGGUAAAAGGGGUUUUGUUUAUCUGUUCUGUUUUAAGUGUUGUUGAUCUCCCAGGCUCAAGUGAUCCUCCCACCUCAGCCUCUCACGUAGUUGGGACUAAAGGCACGCACCACCACACCUGGCUAAUUUUUAUAAACUUAUUUUCUUUUAUUUUUUCGUGACGGAGUCUCGCUUUGUUGUCCAAGCUGGAGUACAGUUGCACAAUCUCGGCUCACUGCAACCUCCGCCUCCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-157.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -164.29
Frequency: 0.0000
Diversity: 62.47
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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