Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PIP5K1A_0005800
Sequence Length
944 nt
GC Content
0.4831
AACCUCAACCAGAACCCUCGGACUUUGCUGCCUAAAUUCUAUGGACUGUACUGUGUGCAGGCAGGUGGCAAGAACAUUCGGAUUGUGGUGAUGAACAAUCUUUUACCAAGAUCGGUAAAAAUGCAUAUCAAAUAUGACCUCAAAGGCUCAACCUACAAACGGCGGGCUUCCCAGAAAGAGCGAGAGAAGCCUCUUCCCACAUUUAAAGACCUAGACUUCUUACAAGACAUCCCUGAUGGUCUUUUUUUGGAUGCUGACAUGUACAACGCUCUCUGUAAGACCCUGCAGCGUGACUGUUUGGUGCUGCAGAGCUUCAAGAUAAUGGAUUACAGCCUCUUGAUGUCAAUCCAUAAUAUAGAUCAUGCACAACGAGAGCCCUUAAGCAGUGAAACACAGUACUCAGUUGAUACUCGAAGACCGGCCCCCCAAAAGGCUCUGUAUUCCACAGCCAUGGAAUCCAUCCAGGGAGAGGCUCGACGGGGUGGUACCAUGGAGACUGAUGACCAUAUGGGUGGCAUCCCUGCCCGGAAUAGUAAAGGGGAAAGGCUUCUGCUUUAUAUUGGCAUCAUUGACAUUCUACAGUCUUACAGGUUUGUUAAGAAGUUGGAGCACUCUUGGAAAGCCCUGGUACAUGACGGAGACACUGUCUCAGUGCAUCGCCCAGGCUUCUACGCUGAACGGUUCCAGCGCUUCAUGUGCAACACAGUAUUUAAGAAGAUUCCCUGUAAGUGGUUUCUACCAAUUGACUGCCUACUCCUGCCCAGUGGCUCCCUUACCCCAAGAGAACAGAGGGCAGGACACCUCUGGUAGGGAGCUGCCAAUGCCAGAGGCCUCUCCUUCCACCUACAUCCCAUGAGAGCCAUUUCUUGUCCUUUGUGUUAGUCUGUCAUAGUCAUUUCCAAGUUGCUGUUUCCCCCUUGGCUCUUCCUGCAUAUGUCAAUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-266.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -287.43
Frequency: 0.0000
Diversity: 347.63
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((..(((...((..(((.((((.....)))).)))..)).)))....(((((((((.(((.(.((((.......(((((((........)))))))((((((......))))))...(((........(((((.....(((.....)))......((((((((...((.((((.((((((((((...)))).........((((........))))........((((((..(((((((........(((((...((((...((((((((((......))))((((((((((((((.(((....))).))))....((((((((((.........))).)))))))...)))).)))))).....)))))).........(((...))).)))))))))........)))))))((((........)))).((.((((((......)))))).))..))))))..(((((...((((((.......(((((((..((..(((...((((((.((((((((.(((...((((((.((((....)))).))))))...(((((((..(((........)))((((((((((.(((((.(.(((..((((...(((((.(((.(((...(((((.(((((...))))).)).)))...)))))))))))(((((........)))))......))))..)).).).))))).)))....))))))).((((....))))..))).))))...((((((((..((.(((...........)))..))..))))))))....))))))))))))))))).))).))..))..))))).........))))))....)))))...)))))).)))).))..))))))))...)))))........))).........)))).).)))))))))))).....))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((((,{((,{,.{{..{{,.{((({{{(({....,,...}|.{(({((.,,||||||,.|||}|}||||.......||{||,|}},,,,..,},))){((((((......))))))}..,(({{{...,}}||,{,,...{((,||..||,......|{,((((({,.({{,,{{,({{{({{||||||||,,{,......{((((,,.,{{..{{{....}|}..,,.,,},.))))}}},,,||||||,{{{,,,{{.....|||{(({({{,|,{|{{((((({,.,||,,.,}})}})))))})},||||,{..{(((((((((.......}.))).)))))))......},},|||||....||||||{...,,{..({(,..}||,||||{{{||{{{|||,.||||,,.((((........)))}.{(.{(((({......}))))}.}}..||||||{|{{(|(...((((((,{,.,.{(({({,,,,{(.{{{{..{{|||{|,||||||}},|{{...{{,{(({(((,,{{{{|||{},,,,|{{{((((,,{,,(,,......,,}}{((((((({{{.{{{{{.,{((({{((,{,,.((({((((({(((...(((((.(((((...))))).)).))).,.))))))))))}{{{{|....}}}}))))}{|||..||||..,,..}},),}},,)))....)))))))}((((....))))...|,{|,||{{{((((((((..((.,((.{{,.....,}),),.))..))))))))....,,,}))))),)),))))}))),))))))}})})))}},,,.,},}})))}..,.}}}}}.}))))))}.}}})}))..})}))))},,,}}}},..,..,},}))))},,},..))))})))))}})))))}}))}..))))
Back