Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PIP5K1A_0007200
Sequence Length
1330 nt
GC Content
0.4519
UGAAGCCUUCUCCUUCCAAAAAGUUUCGGUCUGGCUCAUCUUUCUCUCGGCGAGCAGGCUCCAGUGGCAACUCCUGCAUUACUUACCAGCCAUCGGUCUCUGGGGAACACAAGGCACAAGUGACAACAAAGGCAGAAGUGGAGCCAGGCGUUCACCUUGGUCGUCCUGAUGUUUUACCUCAGACUCCACCUUUGGAGGAAAUCAGUGAGGGCUCGCCUAUUCCUGACCCCAGUUUCUCACCUCUAGUUGGAGAGACUUUGCAAAUGCUAACUACAAGUACAACCUUGGAAAAGCUUGAAGUUGCAGAGUCAGAGUUCACCCAUUAAGCGCAAAGCCUCAGAAGACCUGGAACAAGAUUCUGCCAUCUCUGUGAUCCCAAGAUGUCAGCCCUUGCCCCAGCAAUGCUGAAUUUUCUUCUACUUGGUCAUCAAAAAAGGAGUGUAAUAGAAGUGAGGGGAGCUGCUCCUCCAUCUUCUUCCUGAAGAAGAACCUUCUCUCCUUCCUCUUCCUCAUGAAUGGGCCUUAGUGCCUCAGAGAGUUGAGGACCGCAGCAUCCCCUCCACUCCAGAGUUGGGUGGUAUGGAUUUUCAACUGGCCAACCCUUUGCCUCCACUAUUGAAUUUUUUUCAGACCCCCAUUCUUCAUGCUGGAAAUGGGAUUGCUGGACUUGGCAGCUUUCUUUCCCCUCGUCUUUGACUAGGAACCGGACUCUUAAUUUCCUCAGGACAGACUAGCUGGCACAUUAUCCCUACCUUAGUUCUUUCUCUCUGACUCCUGGAAGAAUACUCCUGUAAUCUCUGUAAAGGUUUUUGGGGGAUAAGGGUGUUUAACCACCUCCCAGCUUUCUUCUUCUUUUUUUUUUUCUGAAAAAAGGAAAAAGCACACAGCACACAAUUUCAAGCCAUUUUCAGAUCAGAACUCCAGAAGUGUUGACAAGAUGCCUAUUCGUAGAGUUCCCUCAGAAGAGCCAUGGUGUUUAUGAAGAGAAGAGUAGUGAUUGCUCUGCCAGAAGCAGCUCCUCUUUAAACUCCUCCUCUCUUGAUGAAUUUCUUAAGGCUGAAGGAAUGAAGAGAGUGGGACAUGGGGUAAUCUUUAUCCCUUUUGUUAAAACAGGAGGCAGCCAUGGGCUGGGAGAUCAUAGCCCUUCCUAGGCAGAAUCCUGUUCACUGCCAGGCUAUAGUAAUUAUUACUAUUUUGCAAUUUGAAAUAUAUUCUGGUUGUUUUUCUAAAUGUGAAGACUUACCAAAUGAAUUUUAGAUCAUUCUCCAGAGGAGAUUUUUUUUGCUCUUCUCAUCUUUUCCAACAGUGUUCUCCUGUUUGUGGAGCUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-387.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -412.49
Frequency: 0.0000
Diversity: 332.33
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((....((..............))...)))))).(((...(((.(((((((((...((.(((((.....)))...........(((((.(.((((((((((((((.(((((....((.(((((..(((((((...(..(((((..(((.....((((((..(((((......(((...(((((...(((((((.....(.((.(((.(((........)))))))).)......))))))).))))).((((((((((..(((.....((((......))))....)))......)))))))))).)))......))))).)))....)))...)))..)))))..)....)))))))...((((((((.(((((...(((((..((((....)))).)))))...........)))))..)))).....((((((..........((((((((((((.......(((((((....)))))))............(((((..((((.(((...(((......))))))))).)..)))))..))))).)))))))))))))(((((.(((.(((.((((..(((((.(((.(((....)))...)))...))))).....)))).))))))))))).....((((((((((((..(((((...((.(((((.(((.((((((.(((...))).)))....(((.........)))...))).)))..))))).))..(((((((((((((.((((((((............))))))))((....))..........))))).....))))))))(((((......))))).)))))..))...(((((((((((.....)))))))))))...((.....)).............))))))))))..........))))..))))).))...)))))....))...)))))).))).))).).)))))......((.(((((((((((((((((((..(((....((((.............((((.(((((((.((...((((........))))..)).))))))).))))...(((((((...))))))).........(((((((..(.(((.((((..(((.........)))..))))))).)..)))))))..))))..)))...)))))))))............(((((((((.((((.((((.((((((........))))))..)))))))).)))))))))...(((((...))))).......)))))))))).))........)).))....))))))))).)))..)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,{(((....((..............))...)))))).(((...(((.(((((((((...((.(((((.....)))...........(((((.({(((((((((((({{.(((((....((.(((({..(({((.(((((.((,{(({.,{{{{..{((({,{{((((.(,...,,.}}}}.(((((....||||||..,,,|}||}|{|}|,|}}},,,.})),)),,|{{{{{{{.|,,,,,,.,})))}||||,,((,,..||,.....((((......)))){{{{|||{{{{{{|||}||||||,({((((.........((.....)).(({((((((..((...((((..((((((..(((((((((((((((..(((((..((((....)))).)))))..,,}}|,,,..,{(,....,,.....(((({(,,.....,,,((((((((((((.......((((({,...}))))|||......,.....{((((..((((.(({..{(((......))))))))).)..)))))..))))).)))))))))))}}(({({((((.(((.((((..{((({.|((,|{|....})),,.))}...))))}.....)))).)))))))}}}}.,....}))}..})))))))).)))..))))))...))))...))..)))))))}...})},,,,)))))).....,,,,,,))},,||,,||||||,...||{{{{||,||||.{{(({{{{............)}}}||}|{(..,.}}|.||{,,,..|}|||,..,|||||}}},{((({.....,)))))})))|||,|}|,.(((((((((((.....))))))))))),,,|{.....))...}}}}}}})))),.)))}),}....,..,|.,,,.,,))))).))...)))))....,}...)))))).)))},)).)}))))),.....((.(((((((((((.{,,((((({,..,}.,)))}(((((((......((((.(((((((.((...((((........))))..)).))))))).)))}...(((((({...}))))))...,|,...(((((((..(.(((.((((..(((......,..)))..))))))).)..)))))))..,|||,{|{,.(((((({...})))))).,,)),(((((((((.((((.((((.({(((((.......))))))..)))))))).))))))))).....,..})))))).......})))))))))).))........)).))....))))))))).)))..)))
Back