Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_PLXND1_0004200

Sequence Length

310 nt

GC Content

0.6097

AUCAACCUGAACGAGAGCAUGCAGGUGGUGAGCAGGCGGGUGGUGACUGUGGCCUAUGGGGAGCCCGUGCACCAUGUCAUGCAGUUUGACCCAGCAGACUCCGGUUACCUUUACCUGAUGACGUCCCACCAGGGCAUGAUCCUGCAGAUCUCGGGCAGCCUGCCCAGCCUCAGUGGCAUGGAGAUGGCCUGUGACUAUGGGAACAACAUCCGCACUGUGGCUCGGGUCCCAGGCCCUGCCUUUGGUCACCAGAUUGCCUACUGCAACCUCCUGCCGAGGGACCAGUUUCCGCCCUUCCCCCCCAACCAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-106.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -112.82

Frequency: 0.0001

Diversity: 86.53

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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