Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PLXND1_0004300
Sequence Length
701 nt
GC Content
0.6348
CUCCAGCCAGAGCAGCUGGACUGUGGAGCUGCUCACCUGCAGCACCCGCUGUCCAUCCUGCAGCCCCUGAAGGCCACGCCCGUGUUCCGCGCCCCGGGCCUCACCUCCGUGGCCGUGGCCAGCGUCAACAACUACACAGCGGUCUUCCUGGGCACGGUCAACGGGAGGCUUCUCAAGAUCAACCUGAACGAGAGCAUGCAGGUGGUGAGCAGGCGGGUGGUGACUGUGGCCUAUGGGGAGCCCGUGCACCAUGUCAUGCAGUUUGACCCAGCAGACUCCGGUUACCUUUACCUGAUGACGUCCCACCAGAUGGCCAGGGUGAAGGUCGCCGCCUGCAACGUGCACUCCACCUGUGGGGACUGCGUGGGUGCGGCGGACGCCUACUGCGGCUGGUGUGCCCUGGAGACGCGGUGCACCUUGCAGCAGGACUGCACCAAUUCCAGCCAGCAGCAUUUCUGGACCAGUGCCAGCGAGGGCCCCAGCCGCUGUCCUGCCAUGACCGUCCUGCCUUCCGAGAUCGAUGUGCGCCAGGAGUACCCAGUGAGUCCUGGGGGAGGCAAGACCCAGCUCGGGACACAGGGGAGCCUCCCUUCACCCAGCACCCAGGCCCCGAGAGGUGGAGACUCCCACCCAUGGUGCCCCAAGGACCUGAAGACAAAUAAUGAGAACAGUGACAAUGACUGGGCUUUCCUGACCAACUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-292.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -303.88
Frequency: 0.0000
Diversity: 117.74
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((.......))))))..)(((.(((((......)))))((((((((((((.((((((((...(((.((((.((..((((...))))...)))))))))((((((((((((((.((((.(...((..((....))..))...))))).))))))).)).)))))..((((....(((...)))..)))))).)))))))))...))).))))))(((...((.(((((((((((((...((((((...((((.......))))...((((....((((.((((((((((.....((((......))))....)))))))))).)))).))))...))))))(((((((.(.(((...((.((((((((((....)))....((((((((.(.(((((.(...((((((.((...(((.((.((.(((.........))))).)).)))....)).))).)))....).))))))))))))))(((((((...((...(((.((((((((.....((.....))((((((.(........).)))))))))))))).))).))...))))))).((((((...))))))......))))))).))))).).)))))))..)))...))))))).))).))...)))..............(((..((((.......))))..)))..........)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{((((((.......))))))..|(((.(((((......)))))((((((((((((.((((((((...((,{((((.((..((((...}))),..))))))))}((((((((((((((.((((.(...((..((....))..))...))))).)))))))},)})))))..((((..,.{{,...}))..)))))).)))))))))...)))}})))))(((..,{(.(((((((((((((,,.{(((((..{({{{.,,{{{{||,,...,|||}}}.((((.((((((((((.....((((......))))....)))))))))).)))).,}))}..)))))|(((((((.(.(((...((.((((((((((....)))....((((((((.(.(((((.(.,.((((((.((...(((.((.((.(((.........))))).)).)))....)).))).)))....).))))))))))))))(((((((...((...(((.((((((((.....{,.....},((((((.(,,...,,.).)))))))))))))).))).))...))))))).{(((({...}))))}...,,.))))))).))))).).)))))))}.}}}},.,}))))).))).}}.}.)))..............(((..((((.......))))..)))......,,..}}}
Back