Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_POLR2A_0001100
Sequence Length
383 nt
GC Content
0.5849
GAUGACCUGACUCACAAACUGGCUGACAUCGUGAAGAUCAACAAUCAGCUGCGGCGCAAUGAGCAGAACGGCGCAGCGGCCCAUGUCAUUGCAGAGGAUGUGAAGCUCCUCCAGUUCCAUGUGGCCACCAUGGUGGACAAUGAGCUGCCUGGCUUGCCCCGUGCCAUGCAGAAGUCUGGGCGUCCCCUCAAGUCCCUGAAGCAGCGGUUGAAGGGCAAGGAAGGCCGGGUGCGAGGGAACCUGAUGGGCAAAAGAGUGGACUUCUCGGCCCGUACUGUCAUCACCCCCGACCCCAACCUCUCCAUUGACCAGGUUGGCGUGCCCCGCUCCAUUGCUGCCAACAUGACCUUUGCGGAGAUUGUCACCCCCUUCAACAUUGACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-124.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -131.89
Frequency: 0.0000
Diversity: 106.19
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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