Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_POLR2A_0001300

Sequence Length

2421 nt

GC Content

0.5506

GAUGACCUGACUCACAAACUGGCUGACAUCGUGAAGAUCAACAAUCAGCUGCGGCGCAAUGAGCAGAACGGCGCAGCGGCCCAUGUCAUUGCAGAGGAUGUGAAGCUCCUCCAGUUCCAUGUGGCCACCAUGGUGGACAAUGAGCUGCCUGGCUUGCCCCGUGCCAUGCAGAAGUCUGGGCGUCCCCUCAAGUCCCUGAAGCAGCGGUUGAAGGGCAAGGAAGGCCGGGUGCGAGGGAACCUGAUGGGCAAAAGAGUGGACUUCUCGGCCCGUACUGUCAUCACCCCCGACCCCAACCUCUCCAUUGACCAGGUUGGCGUGCCCCGCUCCAUUGCUGCCAACAUGACCUUUGCGGAGAUUGUCACCCCCUUCAACAUUGACAGACUUCAAGAACUAGUGCGCAGGGGGAACAGCCAGUACCCAGGCGCCAAGUACAUCAUCCGAGACAAUGGUGAUCGCAUUGACUUGCGUUUCCACCCCAAGCCCAGUGACCUUCACCUGCAGACCGGCUAUAAGGUGGAACGGCACAUGUGUGAUGGGGACAUUGUUAUCUUCAACCGGCAGCCAACUCUGCACAAAAUGUCCAUGAUGGGGCAUCGGGUCCGCAUUCUCCCAUGGUCUACCUUUCGCUUGAAUCUUAGUGUGACAACUCCGUACAAUGCAGACUUUGACGGGGAUGAGAUGAACUUGCACCUGCCACAGUCUCUGGAGACGCGAGCAGAGAUCCAGGAGCUGGCCAUGGUUCCUCGCAUGAUUGUCACCCCCCAGAGCAAUCGGCCUGUCAUGGGUAUUGUGCAGGACACACUCACAGCAGUGCGCAAAUUCACCAAGAGAGACGUCUUCCUGGAGCGGGGUGAAGUGAUGAACCUCCUGAUGUUCCUGUCGACGUGGGAUGGGAAGGUCCCACAGCCGGCCAUCCUAAAGCCCCGGCCCCUGUGGACAGGCAAGCAAAUCUUCUCCCUCAUCAUACCUGGUCACAUCAAUUGUAUCCGUACCCACAGUACCCAUCCCGAUGAUGAAGACAGUGGCCCUUACAAGCACAUCUCUCCUGGGGACACCAAGGUGGUGGUGGAGAAUGGGGAGCUGAUCAUGGGCAUCCUGUGUAAGAAGUCUCUGGGCACGUCAGCUGGCUCCCUGGUCCACAUCUCCUACCUAGAGAUGGGUCAUGACAUCACUCGCCUCUUCUACUCCAACAUUCAGACUGUCAUUAACAACUGGCUCCUCAUCGAGGGUCAUACUAUUGGCAUUGGGGACUCCAUUGCUGAUUCUAAGACUUACCAGGACAUUCAGAACACUAUUAAGAAGGCCAAGCAGGACGUAAUAGAGGUCAUCGAGAAGGCACACAACAAUGAGCUGGAGCCCACCCCAGGGAACACUCUGCGGCAGACGUUUGAGAAUCAGGUGAACCGCAUUCUUAACGAUGCCCGAGACAAGACUGGCUCCUCUGCUCAGAAAUCCCUGUCUGAAUACAAUAACUUCAAGUCUAUGGUCGUGUCCGGAGCUAAAGGUUCCAAGAUUAACAUCUCCCAGGUCAUUGCUGUCGUUGGACAGCAGAACGUCGAGGGCAAGCGGAUUCCAUUUGGCUUCAAGCACCGGACUCUGCCUCACUUCAUCAAGGAUGACUACGGGCCUGAGAGCCGUGGCUUUGUGGAGAACUCCUACCUAGCCGGCCUCACACCCACUGAGUUCUUUUUCCACGCCAUGGGGGGUCGUGAGGGGCUCAUUGACACGGCUGUCAAGACUGCUGAGACUGGAUACAUCCAGCGGCGGCUGAUCAAGUCCAUGGAGUCAGUGAUGGUGAAGUACGACGCGACUGUGCGGAACUCCAUCAACCAGGUGGUGCAGCUGCGCUACGGCGAAGACGGCCUGGCAGGCGAGAGCGUUGAGUUCCAGAACCUGGCUACGCUUAAGCCUUCCAACAAGGCUUUUGAGAAGAAGUUCCGCUUUGAUUAUACCAAUGAGAGGGCCCUGCGGCGCACUCUGCAGGAGGACCUGGUGAAGGACGUGCUGAGCAACGCACACAUCCAGAACGAGUUGGAGCGGGAAUUUGAGCGGAUGCGGGAGGAUCGGGAGGUGCUCAGGGUCAUCUUCCCAACUGGAGACAGCAAGGUCGUCCUCCCCUGUAACCUGCUGCGGAUGAUCUGGAAUGCUCAGAAAAUCUUCCACAUCAACCCACGCCUUCCCUCCGACCUGCACCCCAUCAAAGUGGUGGAGGGAGUCAAGGAAUUGAGCAAGAAGCUGGUGAUUGUGAAUGGGGAUGACCCACUAAGUCGACAGGCCCAGGAAAAUGCCACGCUGCUCUUCAACAUCCACCUGCGGUCCACGUUGUGUUCCCGCCGCAUGGCAGAGGAGUUUCGGCUCAGUGGGGAGGCCUUCGACUGGCUGCUUGGGGAGAUUGAGUCCAAGUUCAACCAAGCCAUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-856.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -902.34

Frequency: 0.0000

Diversity: 503.94

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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