Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_POLR2A_0001500
Sequence Length
479 nt
GC Content
0.5616
GCCAUGCAGAAGUCUGGGCGUCCCCUCAAGUCCCUGAAGCAGCGGUUGAAGGGCAAGGAAGGCCGGGUGCGAGGGAACCUGAUGGGCAAAAGAGUGGACUUCUCGGCCCGUACUGUCAUCACCCCCGACCCCAACCUCUCCAUUGACCAGGUUGGCGUGCCCCGCUCCAUUGCUGCCAACAUGACCUUUGCGGAGAUUGUCACCCCCUUCAACAUUGACAGACUUCAAGAACUAGUGCGCAGGGGGAACAGCCAGUACCCAGGCGCCAAGUACAUCAUCCGAGACAAUGGUGAUCGCAUUGACUUGCGUUUCCACCCCAAGCCCAGUGACCUUCACCUGCAGACCGGCUAUAAGGUGGAACGGCACAUGUGUGAUGGGGACAUUGUUAUCUUCAACCGGCAGCCAACUCUGCACAAAAUGUCCAUGAUGGGGCAUCGGGUCCGCAUUCUCCCAUGGUCUACCUUUCGCUUGAAUCUUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-150.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -158.86
Frequency: 0.0000
Diversity: 111.03
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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