Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_POLR2A_0004200
Sequence Length
250 nt
GC Content
0.3480
GUGGUGGUGGAGAAUGGGGAGCUGAUCAUGGGCAUCCUGUGUAAGAAGUCUCUGGGCACGUCAGCUGGCUCCCUGGUCCACAUCUCCUACCUAGAGAUGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNUUACAGCUGAUCCUCGGGAAGAACAAAGCUAAAGCUGCCUUUUGUCUGUUAUUUUAUUUUUUUGAAGUUUAAAUAAAGUUUACUAAUUUUGACCAAAAGU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-43.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -46.77
Frequency: 0.0058
Diversity: 39.98
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((((((((.((.(((.((((.....((..(.((((((((.(((....)))..))))(((((((((((....)))...((((((.......))))))......................................................))))))))....)))).)..)).......)))).))).)).))))))))).)(((((((((((((((((((...)))))..))))))))..))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.((((({(((.((.(((.((((...{,(({{{.,||||||,.,{,..,,|||,{|,,,(((((((((({....)))...((((((.......))))))......................................................)))))))).}},)))).}..},.......)))).))).)).)))}))))).)(((((((((((((({((({...})))}..))))))))..))))))
Back