Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_POLR2A_0006000
Sequence Length
363 nt
GC Content
0.5675
GAAAAUGCCACGCUGCUCUUCAACAUCCACCUGCGGUCCACGUUGUGUUCCCGCCGCAUGGCAGAGGAGUUUCGGCUCAGUGGGGAGGCCUUCGACUGGCUGCUUGGGGAGAUUGAGUCCAAGUUCAACCAAGCCAUUGCGCAUCCCGGGGAAAUGGUGGGGGCUCUGGCUGCGCAGUCCCUUGGAGAACCUGCCACCCAGAUGACCUUGAAUACCUUCCACUAUGCUGGUGUGUCUGCCAAGAAUGUGACGCUGGGUGUGCCCCGACUUAAGGAGCUCAUCAACAUUUCCAAGAAGCCAAAGACUCCUUCGCUUACUGUCUUCCUGUUGGGCCAGUCCGCUCGAGAUGCUGAGAGAGCCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-113.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -121.46
Frequency: 0.0000
Diversity: 73.18
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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