Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_POLR2A_0006200
Sequence Length
472 nt
GC Content
0.5487
GCGCAUCCCGGGGAAAUGGUGGGGGCUCUGGCUGCGCAGUCCCUUGGAGAACCUGCCACCCAGAUGACCUUGAAUACCUUCCACUAUGCUGGUGUGUCUGCCAAGAAUGUGACGCUGGGUGUGCCCCGACUUAAGGAGCUCAUCAACAUUUCCAAGAAGCCAAAGACUCCUUCGCUUACUGUCUUCCUGUUGGGCCAGUCCGCUCGAGAUGCUGAGAGAGCCAAGGAUAUUCUGUGCCGUCUGGAGCAUACAACGUUGAGGAAGGUGACUGCCAACACAGCCAUCUACUAUGACCCCAACCCCCAGAGCACGGUGGUGGCAGAGGAUCAGGAAUGGGUGAAUGUCUACUAUGAAAUGCCUGACUUUGAUGUGGCCCGAAUCUCCCCCUGGCUGUUGCGGGUGGAGCUGGAUCGGAAGCACAUGACUGACCGGAAGCUCACCAUGGAGCAGAUUGCUGAAAAGAUCAAUGCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-139.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -148.66
Frequency: 0.0000
Diversity: 137.25
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((...((((..((((((((((((.((..((.((((((((((.(((..((((((((((((...((((((.((((...(((......))).))))....))))...))....))))))).)).........)))..))).((((((((((((.((.(.((.(((.(((((.(((..((.((..(.(.((((((......)))))).).)..)).))))).)))))...))).)).).))))))).)).....)))))..)))).)))))))).)).)))).))))))))..))))..........((.(.((((((((...((.((((..(((((((......)))).......(((..((......)))))((((..(((((((..((....))))).)))).....)))).....)))..))))))....)).)))))).).)).((((........)))).))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
{.({{{...((((..((((((((((((.((..((.((((((((((,(,,..||{(((((((((.,.,{,,,(.{,{{,..{({,.....|))|},||....}}}}...)),.,.))))))).)).{,......,))..}||.(((((,{((((,,((.(,{{.(((.(((((.(({..((.((..{.{.((((((......)))))).).}..)).))))).)))))...))).,),,.))))))).,......))))}.,)))).)))))))).)).)))).))))))))..)))).....,{{{.((.{.((((((((,..((.((((..,{{{((,....,|,}}}..,,..,|}}}},,.,,,|||||}}({({..(((({((,.((....))))).)))),,|,.))))...},)))..)))))),...)),)}}}}}.),)).((((........)))).,}}),}
Back