Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_POLR2A_0006800
Sequence Length
206 nt
GC Content
0.4903
GUUUUGGUGACGACUUGAACUGCAUCUUUAAUGAUGACAAUGCAGAGAAGCUGGUGCUCCGUAUUCGCAUCAUGAACAGCGAUGAGAACAAGAUGCAAGAGGAGGAAGAGGUGGUGGACAAGAUGGAUGAUGAUGUCUUCCUGCGCUGCAUCGAGUCCAACAUGCUGACAGAUAUGACCCUGCAGGGCAUCGAGCAGAUCAGCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-57.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -61.53
Frequency: 0.0006
Diversity: 30.90
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.(((....))).))))(.((((......))))....(((.((...((((((((((.(((.(((.(((.((..(((((.((.((....((((((.(.(.(((((((.((.((.(.((...))..).)).)).))))))).).)))))))...))))...))))).))))).)))...))).))))))).)))...)).))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.(((....))).))))({((((......)))).}..(((.((...((((((((((.(((.(((.(((.((..(((({,((.(,{(..((((({,(.(.(((((((.((.((.{.(,...,}..}.)).)).))))))).).)))))))..))},..}}))))).))))).)))...))).))))))).)))...)).))).}
Back