Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_POLR2A_0007300

Sequence Length

2047 nt

GC Content

0.5765

GUGGACGUGCUUAUGGAAGCAGCCGCACACGGUGAGAGUGACCCCAUGAAGGGGGUCUCUGAGAAUAUCAUGCUGGGCCAGCUGGCUCCGGCCGGCACUGGCUGCUUUGACCUCCUGCUUGAUGCAGAGAAGUGCAAGUAUGGCAUGGAGAUCCCCACCAAUAUCCCCGGCCUGGGGGCUGCUGGACCCACCGGCAUGUUCUUUGGUUCAGCACCCAGUCCCAUGGGUGGAAUCUCUCCUGCCAUGACACCUUGGAACCAGGGUGCAACCCCUGCCUAUGGCGCCUGGUCCCCCAGUGUUGGGAGUGGAAUGACCCCAGGGGCAGCCGGCUUCUCUCCCAGUGCUGCGUCAGAUGCCAGCGGCUUCAGCCCAGGUUACUCCCCUGCCUGGUCUCCCACACCGGGCUCCCCGGGGUCCCCAGGUCCCUCAAGCCCCUACAUCCCUUCACCAGGUGGUGCCAUGUCUCCCAGCUACUCGCCAACGUCACCUGCCUACGAGCCCCGCUCUCCUGGGGGCUACACACCCCAGAGUCCCUCUUAUUCCCCCACUUCACCCUCCUACUCCCCUACCUCUCCAUCCUAUUCUCCAACCAGUCCCAACUAUAGUCCCACAUCACCCAGCUAUUCGCCAACGUCACCCAGCUACUCACCGACCUCUCCCAGCUACUCACCCACCUCUCCCAGCUACUCGCCCACCUCUCCCAGCUACUCGCCCACCUCUCCCAGCUACUCACCCACUUCCCCUAGCUACUCGCCCACUUCCCCUAGCUACUCGCCAACGUCUCCCAGCUACUCACCGACAUCUCCCAGCUACUCGCCAACUUCACCCAGCUAUUCUCCCACUUCUCCCAGCUACUCACCUACCUCUCCAAGCUAUUCACCCACCUCCCCCAGCUACUCACCCACUUCCCCAAGUUACUCACCCACCAGCCCGAACUAUUCUCCAACCAGUCCCAAUUACACCCCAACAUCACCCAGCUACAGCCCGACAUCACCCAGCUAUUCACCUACUAGUCCCAACUACACACCUACCAGCCCUAACUACAGCCCAACCUCUCCAAGCUACUCUCCAACAUCACCCAGCUAUUCCCCGACCUCACCAAGUUACUCCCCUUCCAGCCCACGAUACACACCACAGUCUCCAACCUAUACCCCAAGCUCACCCAGCUACAGCCCCAGCUCGCCCAGCUACAGCCCAGCCUCACCCAAGUACACCCCAACCAGUCCUUCUUACAGUCCCAGCUCCCCAGAGUAUACCCCAACCUCUCCCAAGUACUCACCUACCAGUCCCAAAUAUUCACCCACCUCUCCCAAGUACUCGCCUACCAGUCCCACCUAUUCACCCACCACCCCAAAAUACUCCCCAACAUCUCCUACUUAUUCCCCAACCUCUCCAGUCUACACCCCAACCUCUCCCAAGUACUCACCUACUAGCCCCACUUACUCGCCCACUUCCCCCAAGUACUCGCCCACCAGCCCCACCUACUCGCCCACCUCCCCCAAAGGCUCAACCUACUCUCCCACUUCCCCUGGUUACUCGCCCACCAGCCCCACCUACAGUCUCACAAGCCCGGCUAUCAGCCCGGAUGACAGUGACGAGGAGAACUGAGGGCACGUGGGGUGCGGCAGCGGGCUAGGGCCCAGGGCAGCUUGCCCGUGCUGCUGUGCAGUUCUUGCCUCCCUCACGGGGCGUCACCCCCAGCCCAGCUCCGUUGUACAUAAAUGCCUUGUGGCAGAGCUCCCGGUGAACUUCUGGAUCCCGUUUCUGAUGCAGACUCUUGUCUUGUUCUCCACUUGUGCUGUUAGAACUCACUGGCCCAGUGGUGUUCUCACUCCUACCCCACCCACCCCCUGCCUGUCCCCAAAUUGAAGAUCCUUCCUUGCCUGUGGCUUGAUGCGGGGCGGGUAAAGGGUAUUUUAACUUAGGGGUAGUUCCUGCUGUGAGUGGUUACAGCUGAUCCUCGGGAAGAACAAAGCUAAAGCUGCCUUUUGUCUGUUAUUUUAUUUUUUUGAAGUUUAAAUAAAGUUUACUAAUUUUGACCAAAAGU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-475.82 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -511.07

Frequency: 0.0000

Diversity: 509.21

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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