Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PPARA_0007000
Sequence Length
448 nt
GC Content
0.4844
CCUUUUGUCAUACAUGAUAUGGAGACACUGUGUAUGGCUGAGAAGACGCUGGUGGCCAAGCUGGUGGCCAAUGGCAUCCAGAACAAGGAGGCGGAGGUCCGCAUCUUUCACUGCUGCCAGUGCACGUCAGUGGAGACCGUCACGGAGCUCACGGAAUUCGCCAAGGCCAUCCCAGGCUUCGCAAACUUGGACCUGAACGAUCAAGUGACAUUGCUAAAAUACGGAGUUUAUGAGGCCAUAUUCGCCAUGCUGUCUUCUGUGAUGAACAAAGACGGGAUGCUGGUAGCGUAUGGAAAUGGGUUUAUAACUCGUGAAUUCCUAAAAAGCCUAAGGAAACCGUUCUGUGAUAUCAUGGAACCCAAGUUUGAUUUUGCCAUGAAGUUCAAUGCACUGGAACUGGAUGACAGUGAUAUCUCCCUUUUUGUGGCUGCUAUCAUUUGCUGUGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-132.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -141.63
Frequency: 0.0000
Diversity: 165.86
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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