Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PPP1R12A_0000900
Sequence Length
2139 nt
GC Content
0.4002
CUCCAUAGUGAAAAACGGGACAAGAAAUCUCCACUAAUUGAAUCAACAGCAAAUAUGGACAAUAAUCAGUCACAGAAGACCUUUAAAAACAAAGAGACGUUGAUUAUUGAACCAGAGAAAAAUGCAUCCCGUAUUGAAUCUCUGGAACAAGAAAAGGUUGAUGAAGAAGAAGAAGGAAAGAAGGAUGAGUCUAGCUGCUCUAGUGAAGAAGAUGAGGAAGAUGACUCGGAAUCAGAAGCUGAAACAGAUAAGACAAAACCCCUGGCUUCUGUAACUAAUGCCAACACUUCUAGUACACAAGCAGCUCCUGUAGCUGUUACAACACCUACUGUGUCAUCAGGUCAAGCAACACCUACAUCACCUAUUAAAAAGUUUCCAACCACAGCUACAAAAAUUUCUCCCAAAGAAGAAGAGAGAAAAGAUGAGUCUCCUGCAACUUGGAGGUUAGGACUUAGAAAGACGGGCAGCUAUGGUGCACUUGCUGAAAUCACAGCAUCUAAAGAGGGUCAGAAAGAAAAAGAUACUGCAGGUGUUACACGUUCAGCUUCAAGUCCCAGACUUUCCUCCUCUUUGGAUAAUAAAGAAAAGGAGAAAGAUAGUAAAGGAACUAGGCUUGCAUAUGUUGCACCUACAAUACCAAGACGACUAGCCAGUACAUCUGACAUUGAAGAGAAAGAAAACAGAGAUUCUUCAAGUUUGCGAACAAGUAGUUCAUAUACAAGGAGAAAAUGGGAAGAUGAUCUUAAAAAAAAUAGCUCAGUUAAUGAAGGAUCAACGUAUCAUAAAAGUUGCUCCUUUGGUAGAAGACAAGAUGAUUUGAUUAGUUCUAGUGUUCCAAGCACCACAUCAACACCAACAGUUACCUCUGCAGCUGGGCUUCAGAAAAGCCUGCUUUCCAGCACAAGCACUACUACAAAGAUUACAACGGGUUCUUCCUCAGCAGGCACACAAAGCAGUACCUCAAAUCGUUUGUGGGCUGAGGAUAGUACUGAGAAAGAAAAGGACAGUGUUCCUACGGCAGUGACCAUUCCUGUUGCUCCAACUGUUGUAAAUGCUGCAGCUUCUACCACAACCCUGACUACAACUACUGCUGGCACUGUCUCCUCCACAACAGAGGUCAGGGAGAGACGCAGAUCAUACCUCACUCCUGUUAGGGAUGAAGAGUCUGAAUCCCAAAGAAAAGCAAGAUCUAGACAAGCAAGACAAUCUAGAAGAUCAACACAGGGAGUGACAUUAACUGAUCUUCAAGAAGCUGAGAAAACAAUAGGAAGAAGUCGUUCUACCCGAACCAGAGAACAAGAAAAUGAAGAAAAAGAAAAAGAGGAAAAAGAGAAACAAGAUAAAGAGAAACAAGAAGAAAAGAAGGAGUCAGAAACAUCUAGAGAAGAUGAAUAUAAACAAAAGUACUCCAGAACGUAUGAUGAGACUUACCAGCGUUAUAGGCCAGUAUCAACUUCAAGUUCAACCACUCCAUCCUCUUCACUUUCUACUAUGAGCAGUUCACUGUAUGCUUCAAGUCAACUAAACAGGCCAAAUAGUCUUGUAGGCAUAACUUCUGCUUACUCCAGAGGAAUAACAAAAGAAAAUGAAAGAGAGGGAGAAAAAAGAGAAGAGGAGAAAGAAGGAGAAGAUAAAUCACAACCUAAAUCAAUCAGAGAACGACGACGACCAAGAGAGAAAAGAAGAUCUACAGGAGUUUCAUUUUGGACACAAGAUAGUGAUGAAAAUGAACAAGAACAACAAUCAGACACAGAAGAGGGAUCCAAUAAGAAAGAAACUCAGACGGAUUCCAUUUCUAGAUAUGAAACCAGUUCUACAUCAGCUGGUGAUCGAUAUGAUUCCUUGCUGGGUCGCUCUGGAUCAUACAGUUACUUAGAAGAAAGAAAACCUUACAGCAGCAGGCUAGAAAAGGAUGACUCAACUGACUUUAAAAAGCUUUAUGAACAAAUUCUAGCUGAAAAUGAAAAGCUGAAGGCACAGCUACAUGAUACAAAUAUGGAACUAACAGAUCUUAAAUUACAGUUGGAAAAGGCCACCCAGAGACAAGAAAGAUUUGCUGAUAGAUCACUGUUGGAAAUGGAAAAAAGGGAACGAAGAGCUCUAGAAAGAAGAAUAUCUGAAAUGGAAGAAGAGCUCAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-471.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -506.15
Frequency: 0.0000
Diversity: 508.50
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((((....(((...........((((.((.(((.((((.((((.........((((((((((((......)))((((........))))....)))))))))..(((((((..(((((.....)))))...)))))))....((((...(((.((((((..........((((..((.((((((...((..((((((........((((((((.(((((..((.(((((.((.((..(((.((((.......(((((((((((((....................((((.(((((.((((.(((((((((....((((.....))))....((((........))))...........................)))))))))....((((((.(.........).))))))...((((((((((.((...)).)))...))))))).......)))).))).))))))....((((......))))((((((((((((...(((((.....(((..((.((.((.........)).)).)).))).....))))).))))))))))))...........((((..(((((((...((...((((..((((.....)))))))).....))..........((((((((((((..((((....................((((((..((.((.((((.....)))).)).))..))))))))))...))))).............(((.((((.....((((((.((((...........)))).))))))((((((((...........(((((.(((...(((((..............))))).))))))))...(((((((.((((((.....))))))((((........)))).............(((((((((((.((((((((((...(.((((((................))))))))))))))).)).))...........((((......)))).((((((.((....))))))))......)))))))))..)))))))))))))))......))))))).......)))))))))))))).))))...))))))))))))).(((.............)))((((((((..(((((..((...))..)))))...........((((((...............(((.((((((((......(......)......)))))))).)))................((..(..((((((((..........(((.....(((..(((((.......................................................(((((......(((((.....))))).......((....)))))))....(.(((((((...........))))))).)..........)))))..))).....)))..((((((((.((((......(((((((.......(((((((((((...((((...........)))))))).)))))))....)))))))((((..............................))))...)))).))))))))......(((....((....))....)))...........))))))))..)..)).............))))))))))))))((((((((.(.(((......))).).))))))))............(((.....(((((.(((((((....................))))))).))))).....))).(((((((.......)))))))((((.....)))).)))))))..))))))))).))....)))))))).............))))).........))))))..))...)))))).))..))))......)))))).)))...)))).)))).........(((((......)))))...)))).))).)))))).....((((((((.........((((..........))))........))))))))))).....)))))).))))...........(....)...(((((((.............(((........))))))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((((({....,{(,,.........{(((.{{.(((.(((,.((((.........((((((((((((......)))((((.......,)),}....)))))))))..(((((((..(((((.....)))))...)))))))....((({...(((.((((((......,,,.{{((..((.((((((,,,((,,((({((,,.,....{(((........}}}|,..{(((,((({{,..,,,.............,||||||||||{..,...........{{{{|{(({{,,,|||.(((((((((({({(,...{{{{{{.,,|||{{...((((........))))......{{{.,.....,{{.....{{{|,||||,|,....((((((.,.........).))))},...((((((((((.({...}).)))...))))))).......,}},}))).))))}}.,,{((((......||||,{((...((((({{{(.........({{.{((,{({((|.{{{.,{.{(((({,.{{(({...{|||(((({{((((((.....)))))}..,))))..,||,}||...||,.}||||},{|,|..}}},))))))...............,,.(((((({,.{{|,.,.{({{{{{............,..{{((((..((,{{.((((.....)))).}}.})..}}}}}}.,|{{||,|,...}))}........,,{.{(({,,,.,{(((((.((((...........)))).)))))|((((((((....{,,,...,{,,..,,,...(((({...,))))...,,,}|,.......},,....(((((((.((((((.....))))))((((........)))).............(((((((((,{,((((((((((...(.((({{{,,.............,))))))})))))))).,}.,),,,,..,,...((((......)))).{(({((,((....}}}))))),,,,..)))))))))..)))))))))))))))}....,}||||},.......}))))))...{{{{,|{||...||,,.,)),,}))}}}}}}}}}}})).....((((((((((..(((((..((...))..)))))............{{((((({............)))}}},,,||...}}}}}}))))),.....))))))))).))),)))).,.........((..(..((((((((..........,.{.....,,,..{{,,,.............,.........................................(((((......(((((.....)))))........,....}}))))).,{{(.,,{({((,.,,,..{{.,},,,.,,,)..,}}.}},.}})),.}))).....|||{.((((((((.(((({{.,,.{((((((......,(((((((((((...{{{{...........}})})))).)))))))....))))))}{(((...,,,.......................,)})),...}}).))))))))....,.,||,,..{,....,,....,}}...,,......))))))))..)..))...,,.......,}.},)))))))))){(((((((.{.(((......))).).)))))))}..{({{{.....(((.....(((((.(((((((.....{........}.....))))))).))))).....)))..,,,|}}}}...,|||||{{,{(({,...|}})}|),.}}})}}}}},,}}}),))}}.,,}}}}}}}}}}}}...,.....}))}}}},)))}})))))}..}}...)))))).))..))))......)))))).)))...}))).))))....,,...(((((......))))).,,)}}}.}}}.}}))}}.....((((((({.........{(((..........))}}........})))))))}}}.,.,.))))))}}))}...........,....}...(((((((.............{{{........}}})))))))...
Back