Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PPP1R12A_0002300
Sequence Length
1409 nt
GC Content
0.3747
CUACUUGGGAGCUGAGGCAGGAGAAUUGCUUGAACCCGGGAGGUGGAGGUUGCAGUAAGCCAAGAUCGUGCCACUGCAACUCCAGCCUGGGUGACAGAGCAAGACUCCAUCUCAAAUAAAUAAAUAAAUAAAUAUCCACUGCUCCCUACUAUAGUGUUCUGUCAUGGUGACUCAGCUCAUCUGUGUCUCCGCUACUUAAUGCCUUCUCUGUGUUCUGCUCUGCUGCCUACUUCAUUGUCAUGUAAUUCUUCCUGUAUGUCUCUCAGUCAAACCCUGCAAGAGAGGGGAAUUGAUAGAAUUAGCCUGUUACUACCCAGUAUGGAGCAGCCUGUUUUGUUAGUGACCAUUUCAUAGGUCACUGGACAGAAAGUUGCCUGUGGGUCAGGUACCAAUUUCUGUUACCUGGCAAGAGAAGUAGGAUUAAAAAAUAUCCCAGCUUCUGCCUUGGCAGGUACUCUGAGUAUCGCAUCCAGUAUGCUGAGUUAAUAAUGAGAAGUAUAAUUCAUAAAAGUAAAACUGAUAAGCAUUAAAGUAACUUUAAUCAGGGGUUCAACUUUCAGGUAUUUAUCCUGAAUCUACUGUGAACUUUUCCACCUUUUUUUUUUGGCAUUGAUUGACUUCAUAACUAUUCACAAAUACACAAAUAUUUGCGUCAGAUAUUUGCCACAAAUAGCAGUGGCAGUUUUGAUAGUUGCAUGAAAUUAAUCUUGAAGUUUAGGUCUGUUUGAUACUAUUUAGCCAAGAGACUCUGGAAUCCUUGACUCUUGCCCUAGCCCAGGUACCCUCCUUCCCAUAUCAUCUCCAAGGAAGGGAAAAAAUAUGCCAGCUUACCAGAACCAGUUUGCUGAAUACCACUUUGCCAAAUGACCAUUUCACCAGAUUUAACCAUUGUGAUUUUAACAGCUUUAACUGGAAUGUUUAACAAGAAAGUUAACUAAGUAAAAAUACUAUCUAAACUGAUGUUAAUGUUUUCUAAUCAAUGAAAUUGGCAAACCACAUAUAAUUGCUAAAAUCUUCCCAUAUGAAAAAAUCUCCAGUGAAAUGCUAUUUUUCCAUGUUUUGUUAAUUUACAUGUGUUGUUAUUAUUUUGGCUAUUUGAUUUUUUUCAGGUGCUUUUGAAUGUUAUUUAAAAUUUUUUUGGUCUUGUAAAGAGUUUCUAUGAUUUAUUUUUAAAUCCUCACGUGGUGUAUCAGCCUUUGUUUUAUAUUUCUAGCAAUUAAAUGUUUAAAUUCAAAACCAAAAAUAAAUGAGAAUUAACUAAGCAGUCUUAUUCAUAUUUGAAUUAUUAUUUUUUUUAAUGGAUACAGCAUCUCGCUGUGUCACUCAAGCUGGAGUGCAGUGGUACAGUCAGGGCUCACUGCAGCCUCAAUAUCCCUGGCUCAAGCAAUCAUCCCACCUUAGCCUCCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-402.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -429.94
Frequency: 0.0000
Diversity: 295.56
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((((((((((..(((..(((((((((.((.((((....(((((((((((.((((..(((.(((((((((((.(((((((.(((((((((.(((.(((((..(((.((...(((.((((((..........((((((........((((....(.((((((.(((.(((.....))).))).))((........)).....(((.((((((....(((((((((((((...((((((((((.......((((....((((((((..((...((((((((((((..(((((((...(((((.....(((((...(((.(((((...((((((((((((((........))))))).))))))).))))))))))))))))))......)))))))(((((.((((((((((.((((........))))..))))))..)))).)))))...((.(((((.((.....))))))).))......(((((........)))))..........(((((......(((((...))))))))))(((((((...((((((.......)))))).......))))))))))).))))))))....))..))))))))...))))........((((((......)))))).((((((...(((((((........))))))).)))))))))))))))).........))))))..))).........((((..((((.((((((..((.((....)).))))))))..))))....))))...(((((((..............)))))))...........))))....)))))))))...((((((((((((...((((((((((((((((((.((((((...(((.(((.......(((......)))......((((((....((((.....((((....)))).....))))..))))))...((((........))))(((((((...........)))))))........))))))...))))))...)))))))).........(((((...........)))))....)))))....))))).....((((((((.((((.(((...((((..........))))....))))))).)))))))).....((((((....)))))).....))))))).)))))....(((((..((((..((((......)))).))))..))))).........)))).)....))))))))))...(((((....)))))..)))))).)))...)))))..))..))).))).))))))))).)))))))))))))))))).)))..)))).)))))))))))....)))).)).)))))))))..)))..)))))).)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
....{((((((((((((..(((..(((((((((.((.((((..,.(((((((((((.((((..(((.((((((((((,,(((((((.(((((((((.(((.(((,(({((,..{{{.((({(({({{.{{,,,,...((((((........(((({{{{{.((((((.(((.(((.....))).))).))((........)).....(((.((((((.,..((((({{((((((..,((((((((({......,((((....((((((((..((...((((((((((({..{(((((({,.(((((.....(((({..,{{(.(((((...((((((((((((((........)))))))}}}))))},))))))}}))))))))))...,,,)))))))(((((.((((((((((.((((........))))..))))))..)))).)))))|{{({,({{{{.((.....}}))))|||||,,...,{,,{.,.,.,,,)))},....,,....(({{{..,..{{{{{{...))))}))))){((((((...((((((.......)))))).......)))))},)))).))))))))....))..))))))))...)))}.,......((((((......)))))).((((((...(((((((........))))))).))))))))))))))))....,,...)))))}.,|||{{.....}},.,,..,,|{.{(((((..{{.((...,),.)})))))),{||.....,}),.,{{((((({{............,,))))))).........,.))))..,.)))))))))...((((((((((((...(((((({((((({{{(((.((({{(,,,(({{((({..,{{{(((,.,,.{{{{({..,,{(((({....{|||,,...((((....)))).,...,}}},,))))}}..,{{{{........||,,(((((((...........)))))))..,,....,,.,,),..}}}}}),,,))})))}),........{{{{{...,,,,,...))))).}..)}}},,..,})))},((((((......))))))},{{{{((({...}}))))}}.,,,..|}}}},}}})))}}|,......((((((....)))))).....))))))).))))).{{{(((((..((((..((((......)))).))))..))))}.}},.....})))}),,..))))))))))...|{{{{,,,,))}}),,)))))).})}..}))))....}..))).))).))))))))).)))))))))))))))))).)))..)))).))))))))))).,..)))).)).)))))))))..)))..))))))},)))))}
Back