Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PPP1R12A_0005100
Sequence Length
2298 nt
GC Content
0.4073
GUUUUUGAUUGGUCAAGGAGCACAUGUAGGGGCUGUCAACAGUGAAGGAGAUACACCUUUAGAUAUUGCGGAGGAGGAGGCAAUGGAAGAGCUACUUCAAAAUGAAGUUAAUCGGCAAGGGGUUGAUAUAGAAGCAGCUCGAAAGGAAGAAGAACGGAUCAUGCUUAGAGAUGCCAGGCAGUGGCUAAAUAGUGGUCAUAUAAAUGAUGUCCGGCAUGCAAAAUCUGGAGGUACAGCACUUCACGUUGCAGCUGCUAAAGGCUAUACGGAAGUUUUAAAACUUUUAAUACAGGCAGGCUAUGAUGUUAAUAUUAAAGACUAUGAUGGCUGGACACCUCUUCAUGCUGCAGCUCAUUGGGGUAAAGAAGAAGCAUGUCGAAUUUUAGUGGACAAUCUGUGUGAUAUGGAGAUGGUCAACAAAGUGGGCCAAACAGCCUUUGAUGUAGCAGAUGAAGACAUUUUAGGAUAUUUAGAAGAGUUGCAAAAGAAACAAAAUCUGCUCCAUAGUGAAAAACGGGACAAGAAAUCUCCACUAAUUGAAUCAACAGCAAAUAUGGACAAUAAUCAGUCACAGAAGACCUUUAAAAACAAAGAGACGUUGAUUAUUGAACCAGAGAAAAAUGCAUCCCGUAUUGAAUCUCUGGAACAAGAAAAGGUUGAUGAAGAAGAAGAAGGAAAGAAGGAUGAGUCUAGCUGCUCUAGUGAAGAAGAUGAGGAAGAUGACUCGGAAUCAGAAGCUGAAACAGAUAAGACAAAACCCCUGGCUUCUGUAACUAAUGCCAACACUUCUAGUACACAAGCAGCUCCUGUAGCUGUUACAACACCUACUGUGUCAUCAGGUCAAGCAACACCUACAUCACCUAUUAAAAAGUUUCCAACCACAGCUACAAAAAUUUCUCCCAAAGAAGAAGAGAGAAAAGAUGAGUCUCCUGCAACUUGGAGGUUAGGACUUAGAAAGACGGGCAGCUAUGGUGCACUUGCUGAAAUCACAGCAUCUAAAGAGGGUCAGAAAGAAAAAGAUACUGCAGGUGUUACACGUUCAGCUUCAAGUCCCAGACUUUCCUCCUCUUUGGAUAAUAAAGAAAAGGAGAAAGAUAGUAAAGGAACUAGGCUUGCAUAUGUUGCACCUACAAUACCAAGACGACUAGCCAGUACAUCUGACAUUGAAGAGAAAGAAAACAGAGAUUCUUCAAGUUUGCGAACAAGUAGUUCAUAUACAAGGAGAAAAUGGGAAGAUGAUCUUAAAAAAAAUAGCUCAGUUAAUGAAGGAUCAACGUAUCAUAAAAGUUGCUCCUUUGGUAGAAGACAAGAUGAUUUGAUUAGUUCUAGUGUUCCAAGCACCACAUCAACACCAACAGUUACCUCUGCAGCUGGGCUUCAGAAAAGCCUGCUUUCCAGCACAAGCACUACUACAAAGAUUACAACGGGUUCUUCCUCAGCAGGCACACAAAGCAGUACCUCAAAUCGUUUGUGGGCUGAGGAUAGUACUGAGAAAGAAAAGGACAGUGUUCCUACGGCAGUGACCAUUCCUGUUGCUCCAACUGUUGUAAAUGCUGCAGCUUCUACCACAACCCUGACUACAACUACUGCUGGCACUGUCUCCUCCACAACAGAGGUCAGGGAGAGACGCAGAUCAUACCUCACUCCUGUUAGGGAUGAAGAGUCUGAAUCCCAAAGAAAAGCAAGAUCUAGACAAGCAAGACAAUCUAGAAGAUCAACACAGGGAGUGACAUUAACUGAUCUUCAAGAAGCUGAGAAAACAAUAGGAAGAAGUCGUUCUACCCGAACCAGAGAACAAGAAAAUGAAGAAAAAGAAAAAGAGGAAAAAGAGAAACAAGAUAAAGAGAAACAAGAAGAAAAGAAGGAGUCAGAAACAUCUAGAGAAGAUGAAUAUAAACAAAAGUACUCCAGAACGUAUGAUGAGACUUACCAGCGUUAUAGGCCAGUAUCAACUUCAAGUUCAACCACUCCAUCCUCUUCACUUUCUACUAUGAGCAGUUCACUGUAUGCUUCAAGUCAACUAAACAGGCCAAAUAGUCUUGUAGGCAUAACUUCUGCUUACUCCAGAGGAAUAACAAAAGAAAAUGAAAGAGAGGGAGAAAAAAGAGAAGAGGAGAAAGAAGGAGAAGAUAAAUCACAACCUAAAUCAAUCAGAGAACGACGACGACCAAGAGAGAAAAGAAGAUCUACAGGAGUUUCAUUUUGGACACAAGAUAGUGAUGAAAAUGAACAAGAACAACAAUCAGACACAGAAGAGGGAUCCAAUAAGAAAGAAACUCAGACGGAUUCCAUUUCUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-532.32 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -574.03
Frequency: 0.0000
Diversity: 490.87
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((..((((((.....(((.(((((.((((.((((((..(....((((((((((.((((.........(((.........)))((((((...))))))..((((((.....))))))..........(((..(((.(.((........)).).))).)))(((((.(((((((((((.....)))))))........)))).))))))))).))))))))))....).))))))))))))))).)))...))).....((((((....))))))(((((..((((........))))..)))))((((((((..(((((((...))(((((.((((.((......)).))))..))))).((.(((.((...((((((((...(((((.(..(((((((.(((((.((...)).)))))..(((((((((((((...(((((....)))))....)))))..)))).))))....(((.......))).)))))))..........).)).)))....)))))))).....)).))))).........((((((((((((......)))((((........))))....)))))))))..(((((((..(((((.....)))))...)))))))..........(((((((.................((((.((((((..((((((((((((..(((((.((((((.((((.(((((..((.....(((...)))............(((((((((((((....................((((.(((((.((((.(((((((((....((((.....))))....((((........))))...........................)))))))))....((((((.(.........).))))))...((((((((((.((...)).)))...))))))).......)))).))).))))))....((((......))))((((((((((((...(((((.....(((..((.((.((.........)).)).)).))).....))))).))))))))))))...........((((..(((((((...((...((((..((((.....)))))))).....))..........((((((((((((..((((....................((((((..((.((.((((.....)))).)).))..))))))))))...))))).............(((.((((.....((((((.((((...........)))).))))))((((((((...........(((((.(((...(((((..............))))).))))))))...(((((((.((((((.....))))))((((........)))).............(((((((((((.((((((((((...(.((((((................))))))))))))))).)).))...........((((......)))).((((((.((....))))))))......)))))))))..)))))))))))))))......))))))).......)))))))))))))).))))...)))))))))))))......(.((((((....((((((((((..(((((..((...))..)))))..............((((((............))))))........))).))))))).......)))))).)..))..))))).........((.((((....)))).)).......(((.....(((..(((((.......................................................(((((......(((((.....))))).......((....)))))))....(.(((((((...........))))))).)..........)))))..))).....))))))).)))))).))))))))).)))))))).))).))).))))..))))))).....))))).))))))))..........(((((.(((.((((...............................................)))).))).)))))..............)))..)))))))))).......(((..((...(((..........)))...)).)))(((((((.(.(((......))).).)))))))................)))..(((((.(((((((....................))))))).)))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((((..((((((.....(((.(((((.((((.((((((..,....((((((((((.((((....,,,,,(((.......,,|||,((((....|},,||,,((({{{....,))))))....|||||}}||....,...,,........}).)})))....(((((.(((((((((((.....)))))))........)))).))))))))).))))))))))....}.))))))))))))))).)))...)))....,((((((....))))))|,,,,..({((,,,,.,.,||||..}}},,{{((((((..{((({,{{{{{{(((((.((((.({,....,}).)))}..))))|,|..||||....,(((((,(({..((({(,{..{|||{|{,{((((.{(...}}.))))}..(({((({{.,(({,{(((((.....,,||{{.,,,,|||{.,,,),))}.,..,},,......}))))))||}}|,{.....,,,|,|,..,,..,,))))}}},.,,..,|.,|..,.....}},.(((((((({(((......}}}((((.......,)),}....)))))))))..(((((((..(((((.....)))))...)))))))..,,...,,,|||||{|.................((((.((((((..((((((((((((,.{((((.((((((.((((....{(..,{{(((({({,..,.,..............{|||||||||,..,..........,(((((.((((.({(((.((((.(((((((((....{{{{.....)))}....((((........)))).................|,........)))))))))....((((((.,.........).))))},...((((((((((.({...}).)))...))))))).......)))).))).)))))).{(({,((...{(.((((.(((...(((((((((.........(((.((((((((((.(((.((.{(((((..{((((...(((.((((((((((((.....)))))}..,))))...)}.)))...))},}}})))},).}}.))).))))))..................(((((((..{{{,.{.{{,,{{{,..........,,..{|||||..((,{{.((((.....)))).}}.})..}}}}}}.,|{{{{,|,,,.}}}}........{{{.{{{{.....{(((((.((((...........)))).)))))|((((((((....{,,,...,{,,..,,,...(((({...,))))...,,,}|,.......},,....(((((((.((((((.....))))))((((........)))).............(((((((((,{,((((((((((...(.((({{{,,.............,))))))})))))))).,}.,),,,,..,,...((((......)))).{(({((,((....}}}))))),,,,..)))))))))..))))))))))))))),.....}}}}}},.......)))))))...(((({{(((...{(....))...))))))))))))))).....((((((((((..(((((..((...))..)))))............,,((((((............)))))}...,,...)))))))))))......))))))))).))).)))).)}...},.}})}.})}}}}.(((({.,........}}}}}}...................................................................{{{({,.....(((((.....))))).............||}}}}}..,,{.{,{{,{{,.,||,.,,.,}}}},,,}),.})),))}.}})),.})))......,.)))).)))))),))))))))).)))))))).))).))).))))..))),))),,|||||))}.})))))))||.|}}}}..|||||.|||,|(((..............................,.,,........,,,,,)),,.....,},},..,.....,}....)))..))))))))))},.,....,{..((...(((..........)))...)).|}|(((((((.{.(((......))).}.)))))))}...............,,}..(((((.(((((((.....{........}.....))))))).)))))..
Back