Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PPP1R12A_0007200
Sequence Length
1487 nt
GC Content
0.3921
UUUCCAACCACAGCUACAAAAAUUUCUCCCAAAGAAGAAGAGAGAAAAGAUGAGUCUCCUGCAACUUGGAGGUUAGGACUUAGAAAGACGGGCAGCUAUGGUGCACUUGCUGAAAUCACAGCAUCUAAAGAGGGUCAGAAAGAAAAAGAUACUGCAGGUGUUACACGUUCAGCUUCAAGUCCCAGACUUUCCUCCUCUUUGGAUAAUAAAGAAAAGGAGAAAGAUAGUAAAGGAACUAGGCUUGCAUAUGUUGCACCUACAAUACCAAGACGACUAGCCAGUACAUCUGACAUUGAAGAGAAAGAAAACAGAGAUUCUUCAAGUUUGCGAACAAGUAGUUCAUAUACAAGGAGAAAAUGGGAAGAUGAUCUUAAAAAAAAUAGCUCAGUUAAUGAAGGAUCAACGUAUCAUAAAAGUUGCUCCUUUGGUAGAAGACAAGAUGAUUUGAUUAGUUCUAGUGUUCCAAGCACCACAUCAACACCAACAGUUACCUCUGCAGCUGGGCUUCAGAAAAGCCUGCUUUCCAGCACAAGCACUACUACAAAGAUUACAACGGGUUCUUCCUCAGCAGGCACACAAAGCAGUACCUCAAAUCGUUUGUGGGCUGAGGAUAGUACUGAGAAAGAAAAGGACAGUGUUCCUACGGCAGUGACCAUUCCUGUUGCUCCAACUGUUGUAAAUGCUGCAGCUUCUACCACAACCCUGACUACAACUACUGCUGGCACUGUCUCCUCCACAACAGAGGUCAGGGAGAGACGCAGAUCAUACCUCACUCCUGUUAGGGAUGAAGAGUCUGAAUCCCAAAGAAAAGCAAGAUCUAGACAAGCAAGACAAUCUAGAAGAUCAACACAGGGAGUGACAUUAACUGAUCUUCAAGAAGCUGAGAAAACAAUAGGAAGAAGUCGUUCUACCCGAACCAGAGAACAAGAAAAUGAAGAAAAAGAAAAAGAGGAAAAAGAGAAACAAGAUAAAGAGAAACAAGAAGAAAAGAAGGAGUCAGAAACAUCUAGAGAAGAUGAAUAUAAACAAAAGUACUCCAGAACGUAUGAUGAGACUUACCAGCGUUAUAGGCCAGUAUCAACUUCAAGUUCAACCACUCCAUCCUCUUCACUUUCUACUAUGAGCAGUUCACUGUAUGCUUCAAGUCAACUAAACAGGCCAAAUAGUCUUGUAGGCAUAACUUCUGCUUACUCCAGAGGAAUAACAAAAGAAAAUGAAAGAGGUAAGAAUACCAAAUUUUGAAAACACUUUGCUUUCUUCAUAUAAUCCUUUGGAUUAGGGUUUCCUAAAUAAUAAUUCAACAGUAAAGGAACAGCAUCCUAACUUGUGAUUCAUCGAACCUAAACAGAAAGAAUAUGAAGGUUGAGAAUGAGAAAAGUAGAAAACAGAAAUAGAAUAUGGCCUGCUGUUGAUACUAAUAUUUUUAUAACCUAAUACUUCACAAAAAUCUUCAUGUCCACCUACAACGAAAAGUUAAUAUCGAACUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-320.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -352.99
Frequency: 0.0000
Diversity: 288.72
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.((((.((((.......((((((.(.........).))))))...((((((((((.((...)).)))...)))))))...........)))).))))((....)).....((.((((.(((...(((((((((.........(((.((((((((((.(((.((.((((((..(((((...(((.((((((((((((.....))))))...))))...)).)))...)).))))))).)).)).))).))))))..................((((((((((((..((((....................((((((..((.((.((((.....)))).)).))..))))))))))...))))).............(((.((((.....((((((.((((...........)))).))))))((((((((...........(((((.(((...(((((..............))))).))))))))...(((((((.((((((.....))))))((((........)))).............(((((((((((.((((((((((...(.((((((................))))))))))))))).)).))...........((((......)))).((((((.((....))))))))......)))))))))..)))))))))))))))......))))))).......)))))))...(((((.(((...((....))...))))))))))))))).....((((((((((..(((((..((...))..)))))..............((((((............))))))........))).)))))))......))))))))).))).)))).))........))))).(((.(((((.(........))))))..((..(((((((...((((((((((((....(((................................(((((......(((((.....))))).......((....))))))).((((....(.(((.(((..((.........))..))).))).).....)))).....)))..)))))))...)))))....(((((((.......(((((((((((...((((...........)))))))).)))))))....))))))).(((((((((.............(((((.((((((((.....................)))))))).)))))....)))))))))...(((((....(((((.....(((((((((.((((......))))...((.(.((((.((.(((((...((.........)).))))))))))).).))............................)))))))))......)))))....)))))...............))))))).)).......(((.....)))........))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
{((((.((((.((((.,.....((((((.,.........).))))},...((((((((((.({...}).)))...))))))).........,.)))).)))){{....}}{,...{(.((((.(((...(((((((((.........(((.((((((((((.(((.((.{(((((..{((((...(((.((((((((((((.....)))))}..,))))...)).)))...))},))))))}.).}}.))).))))))..................(((((((..{{{,.{.{{,,{{{,..........,,..{{{{{{..((.{{.((((.....)))).}}.})..}}}}}}.,|{{{{}|,,,.}}}}........{{{.{{{{.....{(((((.((((...........)))).)))))|((((((((....{,,,...,{,,..,,,...(((({...,))))...,,,}|,.......},,....(((((((.((((((.....))))))((((........)))).............(((((((((,{,((((((((((...(.((({{{,,.............,))))))})))))))).,}.,),,,,..,,...((((......)))).{(({((,((....}}}))))),,,,..)))))))))..))))))))))))))),.....}}}}}},.......)))))))...(((({{(((...((....))...))))))))))))))).....((((((((((..(((((..((...))..)))))............,,((((((............)))))}...,,...)))))))))))......))))))))).))).)))).)}........))))}.({{,(((((.,........})))))..,,..(((((((....,,,..,{(((....,{{{,..........{{(((((...(((((...((.(((((......(((((.....))))).............||,{,,,.{(((.,.{(,{({.,,{,,{{.||,,....))..))),)}}.|.,,..)))}....))))).)).)))))..))))).}}.,(((((..........)))}}},.((((((....(((((((..,..{{{.(((((({.......)))))))(((((((((.{,....{(((({.,,(({(,((({,{,,,..,....,}}.....,.}))),.))))))....,,.))))))))){((((....))))}.........,..,,{,..((({......)))).|||{.|.((((.((,(((((...{{.........}}.))))))))))).).,.,,}}.............,},.,.)))))))..)))))).......}}}}}....)))....,)),.......))))))).},.......,,{,,...}}}......},})).
Back