Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PPP1R12A_0008100
Sequence Length
1299 nt
GC Content
0.4149
GGCCAAACAGCCUUUGAUGUAGCAGAUGAAGACAUUUUAGGAUAUUUAGAAGAGUUGCAAAAGAAACAAAAUCUGCUCCAUAGUGAAAAACGGGACAAGAAAUCUCCACUAAUUGAAUCAACAGCAAAUAUGGACAAUAAUCAGUCACAGAAGACCUUUAAAAACAAAGAGACGUUGAUUAUUGAACCAGAGAAAAAUGCAUCCCGUAUUGAAUCUCUGGAACAAGAAAAGGUUGAUGAAGAAGAAGAAGGAAAGAAGGAUGAGUCUAGCUGCUCUAGUGAAGAAGAUGAGGAAGAUGACUCGGAAUCAGAAGCUGAAACAGAUAAGACAAAACCCCUGGCUUCUGUAACUAAUGCCAACACUUCUAGUACACAAGCAGCUCCUGUAGCUGUUACAACACCUACUGUGUCAUCAGGUCAAGCAACACCUACAUCACCUAUUAAAAAGUUUCCAACCACAGCUACAAAAAUUUCUCCCAAAGAAGAAGAGAGAAAAGAUGAGUCUCCUGCAACUUGGAGGUUAGGACUUAGAAAGACGGGCAGCUAUGGUGCACUUGCUGAAAUCACAGCAUCUAAAGAGGGUCAGAAAGAAAAAGAUACUGCAGGUGUUACACGUUCAGCUUCAAGUCCCAGACUUUCCUCCUCUUUGGAUAAUAAAGAAAAGGAGAAAGAUAGUAAAGGAACUAGGCUUGCAUAUGUUGCACCUACAAUACCAAGACGACUAGCCAGUACAUCUGACAUUGAAGAGAAAGAAAACAGAGAUUCUUCAAGUUUGCGAACAAGUAGUUCAUAUACAAGGAGAAAAUGGGAAGAUGAUCUUAAAAAAAAUAGCUCAGUUAAUGAAGGAUCAACGUAUCAUAAAAGUUGCUCCUUUGGUAGAAGACAAGAUGAUUUGAUUAGUUCUAGUGUUCCAAGCACCACAUCAACACCAACAGUUACCUCUGCAGCUGGGCUUCAGAAAAGCCUGCUUUCCAGCACAAGCACUACUACAAAGAUUACAACGGGUUCUUCCUCAGCAGGCACACAAAGCAGUACCUCAAAUCGUUUGUGGGCUGAGGAUAGUACUGAGAAAGAAAAGGACAGUGUUCCUACGGCAGUGACCAUUCCUGUUGCUCCAACUGUUGUAAAUGCUGCAGCUUCUACCACAACCCUGACUACAACUACUGCUGGCACUGUCUCCUCCACAACAGAGGUCAGGGAGAGACGCAGAUCAUACCUCACUCCUGUUAGGGAUGAAGAGUCUGAAUCCCAAAGAAAAGCAAGAUCUAGACAAGCAAGACAAUCUAGAAGAUCAACACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-303.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -326.45
Frequency: 0.0000
Diversity: 229.25
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((......)))(((((((.(((((((.......((((..(..((((....))))..)..))))......))))))).))).((.....))((((..(((..(((((.(((((...((((((............((((((((((((......)))((((........))))....)))))))))..(((((((..(((((.....)))))...)))))))...........))))))...........((((..((.((((((.(((.((..((((............(((........)))....((((...)))).................(((((((((((((....................((((.(((((.((((.(((((((((....((((.....))))....((((........))))...........................)))))))))....((((((.(.........).))))))...((((((((((.((...)).)))...))))))).......)))).))).))))))....((((......))))((((((((((((...(((((.....(((..((.((.((.........)).)).)).))).....))))).))))))))))))...........((((..(((((((...((...((((..((((.....)))))))).....))..........((((((((((((..((((....................((((((..((.((.((((.....)))).)).))..))))))))))...))))).............(((.((((.....((((((.((((...........)))).))))))((((((((...........(((((.(((...(((((..............))))).))))))))...(((((((.((((((.....))))))((((........)))).............(((((((((((.((((((((((...(.((((((................))))))))))))))).)).))...........((((......)))).((((((.((....))))))))......)))))))))..)))))))))))))))......))))))).......)))))))))))))).))))...)))))))))))))))))..))))))))).))))..)))))))))))).))....)))...))))..............((((((............)))))).......)).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((......)))(({((((.(((((((.......((((.,{..{(({....)))),.).,)),.......))))))).}}|,((,....,,((((.......|||||,|||.{,..{((({(..,.....,,..((((((((((((......)))((((.......,)),}....)))))))))..(((((((..(((((.....)))))...)))))))...........))))})...........((((..(,{((((((.(((.((..((((..,...,,...((((........))))...||,,...))},..,..............(((((((((((((....................((((.({(((.((((.(((((((((....{{{{.....)))}....((((........)))).................|,........)))))))))....((((((.,.........).))))},...((((((((((.({...}).)))...))))))).......)))).))).}}))))...,((((......))))|(((((((((((...(((((.....(({.,((.((,((....,....)),}},)},}}|.....))))).)))))))))))}...........((((..(((((((...{{...((((..((((.....)))))))).....}}..........(((((((..{({,.{.{{,,,{{,..........,,..{{|||{..((,{{.((((.....)))).}}.})..}}}}}},,|{{{{,|,,,.}}}}........{{{.{{{{.....{(((((.((((...........)))).)))))|((((((((....{,,,...,{,,..,,,...(((({...,))))...,,,}|,.......},,....(((((((.((((((.....))))))((((........)))).............(((((((((,{,((((((((((...(.((({{{,,.............,))))))})))))))).,}.,),,,,..,,...((((......)))).{(({((,((....}}}))))),,,,..)))))))))..))))))))))))))),.....})}}}},.......)))))))))))))).))))...)))))))))))))))))..))))))))).))))..)))).}}.(((((..{{...))..)))))..............((((((............))))))..}))},,..))
Back