Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PPP1R12A_0009400
Sequence Length
1763 nt
GC Content
0.4169
GCUUGCAUUGAUGACAAUGUUGAUAUGGUGAAGUUUCUGGUAGAAAAUGGAGCAAAUAUUAAUCAACCUGAUAAUGAAGGCUGGAUACCACUACAUGCAGCAGCUUCCUGUGGAUAUCUUGAUAUUGCAGAGUUUUUGAUUGGUCAAGGAGCACAUGUAGGGGCUGUCAACAGUGAAGGAGAUACACCUUUAGAUAUUGCGGAGGAGGAGGCAAUGGAAGAGCUACUUCAAAAUGAAGUUAAUCGGCAAGGGGUUGAUAUAGAAGCAGCUCGAAAGGAAGAAGAACGGAUCAUGCUUAGAGAUGCCAGGCAGUGGCUAAAUAGUGGUCAUAUAAAUGAUGUCCGGCAUGCAAAAUCUGGAGGUACAGCACUUCACGUUGCAGCUGCUAAAGGCUAUACGGAAGUUUUAAAACUUUUAAUACAGGCAGGCUAUGAUGUUAAUAUUAAAGACUAUGAUGGCUGGACACCUCUUCAUGCUGCAGCUCAUUGGGGUAAAGAAGAAGCAUGUCGAAUUUUAGUGGACAAUCUGUGUGAUAUGGAGAUGGUCAACAAAGUGGGCCAAACAGCCUUUGAUGUAGCAGAUGAAGACAUUUUAGGAUAUUUAGAAGAGUUGCAAAAGAAACAAAAUCUGCUCCAUAGUGAAAAACGGGACAAGAAAUCUCCACUAAUUGAAUCAACAGCAAAUAUGGACAAUAAUCAGUCACAGAAGACCUUUAAAAACAAAGAGACGUUGAUUAUUGAACCAGAGAAAAAUGCAUCCCGUAUUGAAUCUCUGGAACAAGAAAAGGUUGAUGAAGAAGAAGAAGGAAAGAAGGAUGAGUCUAGCUGCUCUAGUGAAGAAGAUGAGGAAGAUGACUCGGAAUCAGAAGCUGAAACAGAUAAGACAAAACCCCUGGCUUCUGUAACUAAUGCCAACACUUCUAGUACACAAGCAGCUCCUGUAGCUGUUACAACACCUACUGUGUCAUCAGGUCAAGCAACACCUACAUCACCUAUUAAAAAGUUUCCAACCACAGCUACAAAAAUUUCUCCCAAAGAAGAAGAGAGAAAAGAUGAGUCUCCUGCAACUUGGAGGUUAGGACUUAGAAAGACGGGCAGCUAUGGUGCACUUGCUGAAAUCACAGCAUCUAAAGAGGGUCAGAAAGAAAAAGAUACUGCAGGUGUUACACGUUCAGCUUCAAGUCCCAGACUUUCCUCCUCUUUGGAUAAUAAAGAAAAGGAGAAAGAUAGUAAAGGAACUAGGCUUGCAUAUGUUGCACCUACAAUACCAAGACGACUAGCCAGUACAUCUGACAUUGAAGAGAAAGAAAACAGAGAUUCUUCAAGUUUGCGAACAAGUAGUUCAUAUACAAGGAGAAAAUGGGAAGAUGAUCUUAAAAAAAAUAGCUCAGUUAAUGAAGGAUCAACGUAUCAUAAAAGUUGCUCCUUUGGUAGAAGACAAGAUGAUUUGAUUAGUUCUAGUGUUCCAAGCACCACAUCAACACCAACAGUUACCUCUGCAGCUGGGCUUCAGAAAAGCCUGCUUUCCAGCACAAGCACUACUACAAAGAUUACAACGGGUUCUUCCUCAGCAGGCACACAAAGCAGUACCUCAAAUCGUUUGUGGGCUGAGGAUAGUACUGAGAAAGAAAAGGACAGUGUUCCUACGGCAGUGACCAUUCCUGUUGCUCCAACUGUUGUAAAUGCUGCAGCUUCUACCACAACCCUGACUACAACUACUGCUGGCACUGUCUCCUCCACAACAGAGGUCAGGGAGAGACGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-435.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -471.09
Frequency: 0.0000
Diversity: 411.10
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((...........((((...((((.(.(.((.((((((((..((.((((.......((((((((......((((((((....(((((((((.((..(((((((((((.....((((((....((((...))))....)))))).(((.....(((.(((((.((((.((((((..(....((((((((((.((((.........(((.........)))((((((...))))))..((((((.....))))))..........(((..(((.(.((........)).).))).)))(((((.(((((((((((.....)))))))........)))).))))))))).))))))))))....).))))))))))))))).)))...)))....(((((((....)))))))..)))))).))))).))))))...........((((.(((.....(((((.(((((.((((.((......)).))))..))))).)..))))..))).)))).(((.((((.(((...))).)))).))).....)))))......)))))))).(((.(((((((.......((((..(..((((....))))..)..))))......))))))).))).((.....)).............((((.((.(((.........))).))))))((((((((((((......)))((((........))))....)))))))))..(((((((..(((((.....)))))...))))))).........))))))))............((((((.(((..((((((((((((((....))(((((..(((........)))((...((((((((.......................))))))))...))..........))))).((((.(((((.((((.(((((((((....((((.....))))....((((........))))...........................)))))))))....((((((.(.........).))))))...((((((((((.((...)).)))...))))))).......)))).))).))))))...(((((......))))).....(((((.................((((..((((((.....(((..(((((((((......((((((..((((((.....))))))..)))))).((((.(((..((..(((((((((....(((((......))))).)))).)..))))))..)))))))))).)))))).)))....(((.(((.((((((..((.((.((((.....)))).)).))..))))))..(((((......)))))..........))).)))...((((((.((((...........)))).))))))(((.(((.((.(((.............))).)).))).....))).....))))))..))))..)))))))))))))))))........))).)))))).((....)).............(((((((((((.((((((((((...(.((((((................))))))))))))))).)).))...........((((......)))).((((((.((....))))))))......))))))))).)))).))..)))))))).)).).).))))))))...))).))).((((.((((((...((....))...)))).)).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.(((,((....,,,,((((...((((.{.(,(,.((((((((..((.((((.......((((((((..,..,((((((((....(((({..,,{(,..,||,,,{{||||.,,{(((,(({{{{((,(,..||||,...}))))),(((.....(((.(((((.((((.((((((..,....((((((((((.((((....,,,,,(((.......,,|||,((((....|},,||,,((({{{....,))))))....|||||}}||....,...,,........}).)})))....(((((.(((((((((((.....)))))))........)))).))))))))).))))))))))....}.))))))))))))))).)))...)))....{((((({....})))))}..,},}|},|||||{{.{{{{{.........}}|,}}.}))})},{{{,,,(((((.((((.((,....,)).))))..))))).}..}))|......,,||.|||,,{||.|||}}})),})))}{|||.||..}))}),,,...)))))))),,|{,(((((((.......((((.,{..{{{{...,)}))}.}.,}},.......))))))),|}|{{(,....,,{{{{.......,,})}|,},.,{{......,..}...,,))},((((((((((((......)}}((((......,,)),}....)))))))))..(((((((..(((((.....)))))...))))))).........))))))))............((((((.(((.,(((((((((((({{....|,{{{{{.,(((........))){{...((((((((,....................,}))))))))...,......,....}}}}}.((((.({(((.((((.(((((((((....{{{{.....)))}....((((........)))).................|,........)))))))))....((((((.{.........).))))},...((((((((((.({...}).)))...))))))).......)))).))).}}))))...(((((......))))).....{(((({(({{,........,.,{{((.{(((((.{{{.{(.{(((({..{((((...(((,((((((((((((.....))))))..}))))...}}.}))...))},}}})))},|,|,.}}},)))))).},.......,..,{{{.,.,||}.|.}))}}|.{((({(({..............||||||},((,({.((((.....)}}}.},.})..||||,,,||{{,,,|,{,{||||...........|||..}},.}|{((((.((((...........)))).)))))}|,|,{,,.,|.|||},,,}},.}}},}))).||||}}..}))}}......,,},,,....}},.)))))))))))))))))........))).)))))).((....)).............(((((((((,{,((((((((((...(.((({{{,,.............,))))))})))))))).,,.,),.,,..,,...((((......)))).{(({((,((....}}}))))),,,,..))))))))).)))).))..)))))))).}},,.}.))))))))...})).))).((((.((((((...((....))...)))).)).))))
Back