Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_PPP1R12A_0010600
Sequence Length
505 nt
GC Content
0.3822
CUCCAUAGUGAAAAACGGGACAAGAAAUCUCCACUAAUUGAAUCAACAGCAAAUAUGGACAAUAAUCAGUCACAGAAGACCUUUAAAAAUUUCCAACCACAGCUACAAAAAUUUCUCCCAAAGAAGAAGAGAGAAAAGAUGAGUCUCCUGCAACUUGGAGGUUAGGACUUAGAAAGACGGGCAGCUAUGGUGCACUUGCUGAAAUCACAGCAUCUAAAGAGGGUCAGAAAGAAAAAGAUACUGCAGGUGUUACACGUUCAGCUUCAAGUCCCAGACUUUCCUCCUCUUUGGAUAAUAAAGAAAAGGAGAAAGAUAGUAAAGGAACUAGGCUUGCAUAUGUUGCACCUACAAUACCAAGACGACUAGCCAGUACAUCUGACAUUGAAGAGAAAGAAAACAGAGAUUCUUCAAGUUUGCGAACAAGUAGUUCAUAUACAAGGAGAAAAUGGGAAGAUGAUCUUAAAAAAAAUAGCUCAGUUAAUGAAGGAUCAACGUAUCAUAAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-94.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -103.98
Frequency: 0.0000
Diversity: 70.16
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.(((((......((((.......)))))))))............((((((.(((((........))).))...(((((((...........((((.((((.......((((((.(.........).))))))...((((((((((.((...)).)))...)))))))...........)))).)))).....(((((......)))))......)))))))................((.((((((.(((.((.((((((..(((((...(((.((((((((((((.....))))))...))))...)).)))...)).))))))).)).)).))).)))))).)).................(((.....)))...(((((((................)))))))))))))((((.....))))........))))...((((...(.(((((((............(((.....)))))))))).)...)))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.(((((......((((.......)))))))))..,,........((((((.{((((........))).},...(((((((...........((((.((((.{.....((((((.,.........).))))},...((((((((((.({...}).)))...))))))).........,.)))).)))).....(((((......)))))......))))))).............,,.((.((((((.(((.((.{(((((..{((((...(((.((((((((((((.....)))))}..,))))...)).)))...))},))))))},).}}.))).)))))).)}......,,..,,{{...,|}}.,.}))},,.(((((((,..............})))))))))))))((((.....))))........))))...((((...(.(((((((............,,,.....}},))))))).)...)))).....
Back