Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_PPP1R12A_0011700

Sequence Length

1073 nt

GC Content

0.4073

GCUUGCAUUGAUGACAAUGUUGAUAUGGUGAAGUUUCUGGUAGAAAAUGGAGCAAAUAUUAAUCAACCUGAUAAUGAAGGCUGGAUACCACUACAUGCAGCAGCUUCCUGUGGAUAUCUUGAUAUUGCAGAGUUUUUGAUUGGUCAAGGAGCACAUGUAGGGGCUGUCAACAGUGAAGGAGAUACACCUUUAGAUAUUGCGGAGGAGGAGGCAAUGGAAGAGCUACUUCAAAAUGAAGUUAAUCGGCAAGGGGUUGAUAUAGAAGCAGCUCGAAAGGAAGAAGAACGGAUCAUGCUUAGAGAUGCCAGGCAGUGGCUAAAUAGUGGUCAUAUAAAUGAUGUCCGGCAUGCAAAAUCUGGAGGUACAGCACUUCACGUUGCAGCUGCUAAAGGCUAUACGGAAGUUUUAAAACUUUUAAUACAGGCAGGCUAUGAUGUUAAUAUUAAAGACUAUGAUGGCUGGACACCUCUUCAUGCUGCAGCUCAUUGGGGUAAAGAAGAAGCAUGUCGAAUUUUAGUGGACAAUCUGUGUGAUAUGGAGAUGGUCAACAAAGUGGGCCAAACAGCCUUUGAUGUAGCAGAUGAAGACAUUUUAGGAUAUUUAGAAGAGUUGCAAAAGAAACAAAAUCUGCUCCAUAGUGAAAAACGGGACAAGAAAUCUCCACUAAUUGAAUCAACAGCAAAUAUGGACAAUAAUCAGUCACAGAAGACCUUUAAAAACAAAGAGACGUUGAUUAUUGAACCAGAGAAAAAUGCAUCCCGUAUUGAAUCUCUGGAACAAGAAAAGGUUGAUGAAGAAGAAGAAGGAAAGAAGGAUGAGUCUAGCUGCUCUAGUGAAGAAGAUGAGGAAGAUGACUCGGAAUCAGAAGCUGAAACAGAUAAGACAAAACCCCUGGCUUCUGUAACUAAUGCCAACACUUCUAGUACACAAGCAGCUCCUGUAGCUGUUACAACACCUACUGUGUCAUCAGGUCAAGCAACACCUACAUCACCUAUUAAAAAGUUUCCAACCACAGCUACAAAAAUUUCUCCCAAAGAAGAAGAGAGAAAAGAUGAGUCUCCUGCAACUUGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-254.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -276.08

Frequency: 0.0000

Diversity: 266.28

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((((....))))))((((((.((....(((((...))))).....))..))))))((((((((......((((((((....(((((((((.((..(((((((((((.....((((((....((((...))))....)))))).(((.....(((.(((((.((((.((((((..(....((((((((((.((((.........(((.........)))((((((...))))))..((((((.....))))))..........(((..(((.(.((........)).).))).)))(((((.(((((((((((.....)))))))........)))).))))))))).))))))))))....).))))))))))))))).)))...)))....(((((((....)))))))..)))))).))))).))))))...........((((.(((.....(((((.(((((.((((.((......)).))))..))))).)..))))..))).)))).(((.((((.(((...))).)))).))).....)))))......)))))))).(((.(((((((.......((((..(..((((....))))..)..))))......))))))).))).((.....)).............((((.((.(((.........))).))))))((((((((((((......)))((((........))))....)))))))))..(((((((..(((((.....)))))...))))))).........))))))))................(((........)))(((((((...(((.(((((..(((........)))((...((((((((.......................))))))))...))..........)))))....))).)))))))..(((((((((....((((.....))))....((((........))))...........................)))))))))....((((((.(.........).))))))....))))((((........))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((((((....))))))(((((,{(({{.,(((({...}}}},..|||||...,,}},((((((((..,..,((((((((....(((({..,,{(,..,||,,,{{||||.,,((((,(({{{{((,(,..||||,...}))))),(((.....(((.(((((.((((.((((((..,....((((((((((.((((....,,,,,(((.......,,|||,((((....|},,||,,((({{{....,))))))....|||||}}||....,...,,........}).)})))....(((((.(((((((((((.....)))))))........)))).))))))))).))))))))))....}.))))))))))))))).)))...)))....{((((({....})))))}..,},}|},|||||{{.{{{{{.........}}|,}}.}})}}},{{{,,,(((((.((((.((,....,)).))))..))))).}..}))|......,,||.|||,,{||.|||}}})),})))}{|||.||..}))}),,,...)))))))),,|{,(((((((.......((((.,{..{{{{...,}}))}.}..}},.......))))))),|}|{{(,....,,{{{{.......,,}}}|,},.,{{...,..,..,...,,})},((((((((((((......)}}((((......,,)),}....)))))))))..(((((((..(((((.....)))))...))))))).........))))))))............,,......,,....,||},{(((((...(({.{{{{{.,(((........)))|,...((((((({,....,,..............,}))))))))...},..........)))))..},},,.}))}))),,{(((({(((,....,{{,,..,|}},,...||||.....,,,),)),}.}}))}}}}},...,{|,.......,,}))),,.....((((((.{.........).))))},....))))((((........))))